Chapitre 5 transcription LV101 .pdf
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CHAPITRE 5 : LA TRANSCRIPTION
Modalités générales de la transcription
I Modalités générales de la transcription
La transcription
correspond au transfert d’une information 3'contenue
dans l’ADN à une
brin non transcrit
5'
ADN
molécule
d
’ARN
=
>
«
Transformer»
l
’information
d
e
l
’ADN
e
n
u
ne
m
olécule
d’ARN.
3'
5' brin transcrit
La synthèse
de polymérase
cet ARN nécessite néanmoins
une enzyme capable de créer des liaisons ester
ARN
sens de transcription
(Donc d’associer des nucléotides) à savoir : L’ARN POLYMÉRASE .
L’ARN polymérase
est dépendante de l’ADN puisque pour
effectuer la transcription, elle est
5'
3' brin non transcrit
obligée de s’y attacher.
G
A
C
C
T
A
G
A
ADN
C
T
G
G
A
T
C
T
Elle va se Qixer s3'ur une région spéciQique : la Région Promotrice
et c’est ce qui va déclencher
5' brin transcrit
la transcription.
Elle va transcrire un des deux brins, qui sera alors appelé Brin transcrit et va le copier de
G
C
A
C
U
A
G
A
ARNun ARN qui sera toujours complémentaire et anti parallèle à ce dernier.
façon à faire
5'
3'
Modalités générales de la transcription
On aura ARN
a donc
le brin
transcrit (Ou etbrin
MATRICE)
ais d’ADN
aussi ltranscrit
e brin non transcrit (Ou ne
toujours
complémentaire
anti-parallèle
dumbrin
s’est pas 6ixé l’ARN polymérase) et l’ARN correspondant au brin transcrit.
Poly page 19
Remarque : le sens de la
5'
3' brin non transcrit
transcription/lecture se
ADN
3'
5' brin transcrit
fait toujours de
l’extrémité 3’ à 5’, et
ARN polymérase
sens de transcription
l’ARN obtenu a pour
sens 5’-‐3’
Modalités générales de la transcription
Transcription =
3' brin non transcrit
A
C
C
T
Aentre
G ribonucléotides
A
formation
deGliaisons
phosphodiester
successifs
ADN
5'
Comment fonctionne
dAe transcription
C ce
Tmécanisme
G
G
T
C
T ?
5' brin transcrit
3'
L’ADN Polymérase va
catalyser la liaison
ARN
azotée
entre le OH du carbone
5'
3'
3’ du ribonucléotide N
P
CH
O
ARNP toujours
complémentaire
et anti-parallèle du brin d’ADN
transcrit
5'
(Premier)
avec le
liaison N-glycosidique
β
α
Phosphate
du carbone
β-ribose
5’ du ribonucléotide
N
Poly page 19
ribonucléotide n
3'
2'
+1 (Deuxième)
G
P
γ
A
C base
C
U
A
G
A
2
OH
OH
liaison ester
Modalités générales de la transcription
ribonucléotide n+1
Transcription =
formation de liaisons phosphodiester entre ribonucléotides successifs
2
La transcription du brin se déroule en plusieurs étapes :
-‐ L’initiation :
Comment son nom l’indique c’est le départ de la transcription lancé par la rencontre entre la
région promoteur et l’ARN polymérase.
-‐ L’élongation:
C’est le déroulement de la transcription (Entre l’initiation et la Qin)
re d’un gène et étapes de son expression
-‐La terminaison :
L’ARN pd’une
olymérase
rencontre
une région appelée
«terminateur»
qui provoque
la
transcription
unité
de transcription
comprend
3 étapes
:
détachement de l’enzyme et donc la Qin de la transcription.
a
nitiation
La région transcrite (à savoir la région entre le promoteur et le terminateur) est appelée
élongation
Unité de transcription. (Cf image ci dessous)
terminaison
terminateur
nucléotide +1
uence(s) de
égulation promoteur
unité de transcription
3'
5'
Transcription
II Transcription chez les Procaryotes
Maturation (gènes eucaryotes)
N polymérase
bactérienne
L’ARN polymérase bactérienne
bactérienne
estpolymérase
composée
de 5 sous-unités
αd2e
ββ(ω)σ
L’ARN
bactérienne
est cséquence
omposée
5 sous unités :
codante
α 2 , β , β (ω ), σ
L’ARN polymérase
α2ββ(ω)σ
5'UTR bactérienne est composée de 5 sous-unités
3'UTR
ARNm
5'
β'
AUG
α
β
α
3'
5'
α
s
5' σ
brin non transcrit
β
brin transcrit
3'
5'
α
3'
3'
"stop"
β'
sσ
~ 60 nucléotides
brin non transcrit
brin transcrit
ul des 2 brins est transcrit par unité de transcription
~ 60 nucléotides
assemblées forment 3 domaines fonctionnels de l’enzyme
Ces 5 sous-unités assemblées
forment
3 domainesCes
fonctionnels
intérieur
du complexe
sous unités vde
ont l’enzyme
s’assembler pour
former 3 domaines fonctionnels de
intérieur du complexe
l’enzyme
La transcription
sites d'interaction avec l'ADN
site catalytique
(α et β’)
(β)
Poly page 19
ités générales de la transcriptionsites d'interaction avec l'ADN
cription chez les Procaryotes
(α et β’)
site catalytique
(β)
Poly page 19
2) L’initiation
Comme nous l’avions dit précédemment, l’initiation débute par la Qixation de l’ARN
polymérase sur la région «Promoteur» du brin qui sera transcrit.
Cette région de 40 pb (Paire de bases) est composée de deux séquences précises surnommées
«boîtes»
L’initiation
de ela
La boîte «-‐35»
t la transcription
boîte «-‐10» (Ou boîte TATAAT) chacune composée de 6 nucléotides . Le
nombre «-‐XX» représente la distance (En pb) entre la boîte et le premier nucléotide qui sera
transcrit.
cription débute
par la fixation de l’ARN Polymérase sur le promoteur
L’initiation de la transcription
1er nucléotide transcrit
boîte -35
boîte -10
La transcription débute par la fixation de l’ARN Polymérase sur le promoteur
Boîte TATA
Boîte de Pribnow
-35
σ
-10
T T GA C A
TATAAT
A A C T GT
AT ATTA
+1
3'
1er nucléotide transcrit
N
boîte -35
5' boîte -10
Boîte TATA
Boîte de Pribnow
-35
5'
ADN
σ
-10
T T GA C A
TATAAT
A A C T GT
AT ATTA
3'
+1
3'
N
5'
Poly page 20
L’initiation de la transcription
Poly page 20
cription débute par la fixation de l’ARN Polymérase sur le promoteur
1er nucléotide transcrit
boîte -35
boîte -10
L’initiation de laL’initiation
transcription
va débuter par la Qixation
des deux sites d'interactions de l’ARN
polymérase sur la boîte -‐35 et -‐10.
La transcription débute Npar la fixation de l’ARN Polymérase sur le promoteur
-35
-10
T T GA C A
TATAAT
A A C T GT
AT ATTA
+1
3'
L’enzyme va donc
se Qixer transcrit
de manière
1er nucléotide
très spéciQique.
5'
σ
sens de transcription
~ 40 nucléotides
boîte -35
~ 20 nucléotides
boîte -10
~ 60 nucléotides
5'
ADN
3'
-35
-10 20
Poly page
T T GA C A
TATAAT
A A C T GT
AT ATTA
σ
+1
3'
N
5'
Ce qui permet à L’ARN polymérase de se Qixer est sa sous unité Sigma
σ
Appelée aussi « σ 70», elle reconnaît l’ADN en amont de la boîte 35.
α β , β (ω ), eσt pèse 500kDa
α , β , β (ω ), σ
Si l’on y ajoute sigma = Holoenzyme = 2
,
L’ensemble du core ou apoenzyme réuni les parties 2
L’initiation de la transcription
de
la
transcription
Au cours L’initiation
de la
transcription, les deux
brins
d’ADN
vont
être légèrement séparés au niveau du
L’initiation
de
la
transcription
1- Complexe
fermé
________________________________
promoteur aQin que la polymérase puisse s’y Qixer.
Cette
petite ouverture
1Complexe
fermé effectuée par certaines enzyme au niveau du promoteur s’appelle
1Complexe
ferméet va suivre la polymérase tout au long de la transcription.
«Bulle de transcription»
2- Complexe ouvert
2- Complexe ouvert
2- Complexe ouvert
Ensuite
:
3- Formation
du primer
Lors de la transcription, la facteur sigma va se dissocier de l’ADN polymérase puisqu’elle ne
3- Formation du primer
sert 3qu’à
l’initiation
la transcription
Formation
dude primer
4- Dissociation du facteur σ
4- Dissociation du facteur σ
4- Dissociation du facteur σ
5- Elongation de l’ARN
Après la dissociation du facteur sigma, la polymérase continue à avancer, cette phase qui
s’arrête lors de la terminaison est appelée «Phase d’élongation»
5- Elongation de l’ARN
5- Elongation de l’ARN
L’élongation de la transcription
L’élongation
de la transcription
Progression de l’ARN polymérase sur l’unité de transcription
L’élongation de la transcription
Progression de l’ARN polymérase sur l’unité de transcription
Progression de l’ARN polymérase sur l’unité de transcription
3- Formation du primer
3) Elongation de l’ADN
Cette phase d’élongation est assurée par l’Apoenzyme (Rappel : ADN polymérase sans sigma
4- Dissociation
du facteur σ
= Apoenzyme)
L’ADN a besoin d’être déroulé pour que l’ARN polymérase puisse continuer son chemin.
Ce déroulement est permis par des enzymes : Les topoisomérases. Elle déroulent donc les
5- Elongation
de l’ARN
deux brins
d’ADN se situant en face de l’enzyme mais ré-‐enroulent aussi ensuite l’ADN après
le passage de la polymérase.
L’extrémité 5’ de l’ARN formé est un triphosphate.
Dans la bulle de transcription dont nous avions parlé tout à l’heure il y a sans cesse formation
de 8 paires de bases d’ARN-‐ADN.
L’élongation de la transcription
Progression de l’ARN polymérase sur l’unité de transcription
L’élongation est assurée par l’apoenzyme
Il y a plusieurs transcrits à partir du même gène
Des topoisomérases suivent et précèdent l’ARN Pol
Poly page 20
La Qin de l’élongation est caractérisé par une nouvelle phase, la phase de «terminaison» qui
comme son nom l’indique, correspond à la Qin de la transcription.
Nous allons voir comment se déroule cette phase.
6
Terminaison de la transcription
4) Terminaison de la transcription
Structure du terminateur de transcription, séquence d’ARN
Au cours de la transcription, l’ADN polymérase va rencontrer un site, appelé site de
terminaison (Cf image ci dessous). "boucle"
Terminaison de la transcription
La Qin de la transcription est alors initiée au niveau d’une
C’est une «Région Palyndromique»
séquence
appelé le «terminateur»
au bout
de la séquence
Structure
du terminateur
de transcription,
séquence
d’ARN riche en GC dont la structure est
du brin transcrit :
semblable à une Tige/Duplex suivie
d’une Boucle
"boucle"
"tige" riche en G-C
répétition de U Cette
région forme une tige car les G et
C forment de faibles liaisons. le brin se
replie
3' donc sur lui même pour former
cette tige.
5'
On a des séquences qui ne peuvent
pas s’associer car non
complémentaires, elles forment donc
naturellement une boucle.
Structure en “tige-boucle”
répétition de U
"tige" riche en G-C
5'
3'
Poly page 20
Structure en “tige-boucle”
La rencontre de ce site terminateur va provoquer une déstabilisation au niveau des liaisons
entre l’ADN et l’ARN, qui va donc se décrocher complètement.
Ce détachement de l’ARN est suivie de la dissociation de la polymérase.
Poly page 20
Terminaison de la transcription
=> C’est la Qin de la transcription.
Mécanisme de terminaison de la transcription
ARN polymérase α2ββ’
terminateur
ADN
brin non transcrit
Terminaison de la transcription
b'
5'
3'
Mécanisme de terminaison de laUUUUUU
transcription
3'
AAAAAA
5’ppp
5'
3'
brin transcrit
ARN polymérase α2ββ’
terminateur
ARN néo-synthétisé
ADN
3'
5'
On note la structure
boucle tige, et ensuite,
une séquence de type
AUAUAUAUAU.
Cette séquence liée par
des faibles liaisons
facilite le décrochement
brin non transcrit
b'
3'
-‐La vitesse moyenne de la transcription chez les procaryotes
est de 5β0 Nucléotides/s.
5'
α
ARN néo-synthétisé
’ppp
ADN
UUUUUU 3'
AAAAAA
α
brin transcrit
3'
5'
5'
3'
ARN néo-synthétisé libre
α
UUUUUU 3'
β
β'
α
ADN
5’ppp
5'
3'
Poly page 20
4) Les particularités de la transcription des procaryotes
Les particularités de la transcription procaryote
Une unité de transcription est une région d’ADN encadré par un promoteur en amont et un
terminateur en aval, et qui comporte souvent un gène.
La transcription chez les procaryotes peut être polycistronique.
La transcription chez les procaryotes a une particularité, c’est qu’elle peut être
promoteur
1 UT
gène
1
gène p
2 ar la transcription
gène 3
polycistronique,
c’est
à dire que
l’ARNm
obtenu
pterminateur
eut porter plusieurs
ADN
gènes. Ainsi, pour une même unité de transcription
1 ARNm
ARNm
3'
5'
Ces
plusieurs gènes seront transcris en un seul ARN messager.
3 protéines
protéines
protéine 1
protéine 2
protéine 3
Par contre, lors de la traduction
on obtiendra
bien les 3 protéines
des 3 gènes différents de
l’unité de transcription.
Les particularités de la transcription procaryote
ex. : Opéron lactose d’Escherichia coli (prix nobel Jacob, Monod, Lwollf, 1965)
La transcription chez les procaryotes peut être polycistronique.
1 UT
promoteur
ADN
1 ARNm
3 protéines
ARNm
gène 1
gène 2
gène 3
terminateur
3'
5'
protéines
protéine 1
protéine 2
protéine 3
ex.c:hez
Opéron
d’Escherichia
(prix ànobel
Jacob, Monod, Lwollf, 1965)
2) La transcription
les plactose
rocaryotes
peut être coli
couplée
la traduction
Si l’on observe de l’ARN en cours de synthèse (Néo-‐synthétisé) on voit des ribosomes qui sont
accollés à lui
=> Les ribosomes n’attendent pas la Qin de la transcription avant de commencer la traduction
comme on peut le voir ci-‐dessous :
Les particularités de la transcription procaryote
La transcription chez les procaryotes peut être couplée avec la traduction.
ARN
polymérase
brin non transcrit
ADN
5'
3'
3'
5'
brin transcrit
protéine en cours de synthèse
3'
ribosome
ARN en cours de synthèse
5'
Les particularités de la transcription procaryote
Il existe donc un couplage Transcription/Traduction
La transcription chez les procaryotes peut être couplée avec la traduction.
ARN
polymérase
ADN
brin non transcrit
1. L’ARN polymérase
2. Etapes de la transcription
3. Particularités de la transcription procaryote
III. Transcription chez les Eucaryotes
III Transcription
les Eucaryotes
1. Les ARNchez
polymérases
2. Etapes de la transcription
1) Les
RN polymérases
eucaryotes
3. A
Maturation
des ARN
pré-messagers
4. Particularités de la transcription des ARNm eucaryotes
Tout d’abord, étant donné que chez un rganisme procaryote il n’y a pas d’enveloppe nucléaire,
Transcriptionon
des
gènesà cribosomiques
ni de c5.
ompartiments,
s’attend
e que la transcription chez les eucaryotes soit bien plus
6. Localisation cellulaire de la transcription
complexe.
IV. Quelques éléments de régulation de la transcription
En effet, il existe 3 ARN polymérase différentes ayant des fonctions différentes.
1. Régulation
Chacune
d’elles est à chez
peu ples
rès éProcaryotes
quivalente au niveau de la masse à la polymérase bactérienne.
2. Régulation chez les Eucaryotes
L’ARN polymérase I se situe dans le nucléole, et transcris/synthétise l’ARNr
(Ribosomique)
L’ARN polymérase II se situe dans le nucléoplasme et va synthétiser un ARNm (ARNhn)
puisque ce sont des ARN prémessagers = ARN hétérogènes (d’où le hn) et certains petits ARN.
L’ARN polymérase III est aussi située dans le nucléoplasme et va assurer la transcription des
ARNt (Transfert) ainsi que l’ARN ribosomique 5S (Non transcrit pas le ARN pol I) mais
aussi d’autres petits ARN.
Les ARN Polymérases eucaryotes
Ces polymérase ont des sous unités différentes, ne se Qixent pas aux mêmes régions
promotrices et ont des sensibilités à des poisons qui sont différentes.
ARN polymérase
Localisation
Gènes transcrits
sensibilité α-amanitine
ARN pol I
Nucléole
ARNr(28S, 18S, 5.8S)
-
ARN pol II
Nucléoplasme
ARNm (ARNhn), + 4 snARN
+
ARN pol III
Nucléoplasme
ARNt, snARN, ARNr5S
+/-
L’amanitine alpha est une toxine extraite d’un champignon mortel.
2) L’initiation de la transcription eucaryote :
On retrouve comme chez la bactérie, un promoteur.
Près de lui, deux boîtes vitales, la boîte TATA (-‐35 Nucl) mais appelée cette fois-‐ci Boîte
Goldberg-‐Hogress. Ainsi que la boîte CAAT (à -‐70 Nucl).
en ruban
de l’ARN
Pol II
Par contre, contrairement aux procaryotes où l’ARN pReprésentation
olymérase peut
se Qixer
et reconnaître
(d’après
données d
cristallographiques)
seule le promoteur, il faut nécessairement la formation
d’un les
complexe
e pré-‐initiation chez
les Eucaryotes.
La transcription va aussi être régulée, par des régions qui sont très loins du site de
transcription. Ces régions sont appelées «Enhancer» et situées à -‐10/-‐50 kb du site
promoteur ou à +10/+50kb ou à l’intérieur d’un intron.
Mais c’est la région promoteur que nous allons étudier dans ce chapitre.
Initiation de la transcription eucaryote
Structure d’un gène eucaryote
Ainsi, il enhancer
existe des facteurs indispensables à la Qixation de l’ARN polymérase (ici la II) à la
Régions
Promoteur
Exons
Introns
région promotrice, ce sont des facteurs de transcription, TF II (Transcription Factors et II
pour polymérase II)
Éléments cis-régulateurs
La transcription débute par la formation du complexe d’initiation de la transcription
TFIIF
TFIIE
TFIIH
TFIID
ARN polymérase II
TBP
5'
3'
3'
5'
promoteur
boîte TATA
TFIIB
+1
sens de la transcription
Parmi ces facteurs l’élément clef est l’unité TFIID puisque c’est le seul facteur capable
d’assurer la liaison avec l’ADN au niveau de la boîte TATA. En effet c’est la TBP (Tata Binding
Protein), une des protéines qui constitue le facteur TFIID qui permet cette Qixation.
Si TOUT les facteurs
ne sont
Qixés, on a pas de Qixation du peucaryote
romoteur avec l’ARN
Initiation
de
lapas transcription
polymérase, et par conséquent, pas de transcription.
La transcription débute par la formation du complexe d’initiation de la transcription
IV Quelques éléments de la régulation de la transcription
Les Arn messager en cours de transcription sont munis d’une coiffe à l’extrémité 5’.
=> Il est appelé ARNm cappé.
1- Reconnaissance
la Qin
de l’élongation il va rencontrer un signal de terminaison de transcription appelé
de la boîte À
TATA
par
aussi
«
site
de polyadénylation».3- Interaction de l’ARN Pol II
TFIID (TBP + TAF)
Terminaison de la transcription eucaryote
L’ARN messager en fin de transcription
muni
d’une
“queue polyA” à l’extrémité 3’.
(+ facteurest
TFIIF)
sur
l’ADN
signal de terminaison
5'
2- Stabilisation
du: 7-méthyl-guanosine
"coiffe"
complexe
5'
site de coupure
AAUAAA
ARN
polymérase II
4- Phosphorylation de la région
C-term de l’ARN PolII
AAUAA 3'
A
poly(A)-polymérase
ARN
polymérase II
Terminaison de la transcription eucaryote
Terminaison de la transcription eucaryote
Une messager
fois ce site
ranscrit,
on a des eest
ndonucléases
qui vont
digérer
la molécule
L’ARN
entfin
de transcription
muni d’une “queue
polyA”
à l’extrémité
3’. d’ARN en 3’ de
ce signal (Donc à la Qin de sa séquence).
site est
de coupure
L’ARN messager en signal
fin dedetranscription
muni d’une “queue polyA” à l’extrémité 3’.
terminaison
Ensuite l’ARN polymérase se détache et d’autres enzymes apparaissent : les poly(A)-‐
site deARN
coupure
AAUAAA
5'
polymérase.
Cette enzyme
va former
au bout de polymérase
l’ARN (Donc
en 3’) une séquence qui sera la
signal
de terminaison
II
queue de l’ARNm.
"coiffe" : 7-méthyl-guanosine
5'
AAUAAA
ARN
polymérase II
"coiffe" : 7-méthyl-guanosine
AAUAA 3'
A
poly(A)-polymérase
5'
ARN
polymérase II
ARN
AAUAA
5'
3'
polymérase II
A
poly(A)-polymérase
Cet
st donc uAAAAAAA
n ARN
pré-‐messager car non-‐mature puisqu’il
5' ARN qui sort de la transcription eAAUAAA
porte une coiffe en 5’ et une queue polyA en 3’.
A
AAUAAA AAAAAAA
queue polyA
A
AAUAAA
AAAAAAAA...AAAAAAAAOH
3'
5'
"coiffe"
5'
Un ARN pré-messager eucaryote porte une "coiffe" en 5' et une queue polyA en 3'.
Poly polyA
page 21
queue
"coiffe"
AAUAAA
5'
AAAAAAAA...AAAAAAAAOH 3'
Un ARN pré-messager eucaryote porte une "coiffe" en 5' et une queue polyA en 3'.
Poly page 21
Mais à quoi servent ces modiQications ?
Maturation des ARN messagers eucaryotes
Ces ARN ont une durée de vie très courte puisqu’ils sont très sensibles à la digestion
La plupart
des ARN messagers
eucaryotes
maturation
endonucléases
et d’autre
enzymes nécessitent
présentes une
dans
le noyau. après la transcription.
terminateur
Ainsi, la coiffe et la queue permettent a l’ARN de se protéger m
ais aussi d’assurer une
transcription codant une protéine
meilleure Qixation unité
des rde
ibosomes.
promoteur
Maturation des ARN messagers eucaryotes
+1 exon 1
ADN 5'
3'
exon 2
intron 1
exon 3
exon
4
3'
5'
intron 3
intron 2
La plupart des ARN messagers eucaryotes nécessitent une maturation après la transcription.
TRANSCRIPTION
terminateur
ARN pré-messager
promoteur
unité de transcription codant une protéine
AAAAA...AAAAA 3'
5'
5'
ADN "coiffe"
queue polyA
+1 exon 1
3'
ARN messager mature 5'
ARN pré-messager
"coiffe"
exon 2
MATURATION
intron 1
exon 1
exon 3
intron 2
TRANSCRIPTION
exon
2
exon 3
exon
4
exon
4
intron 3
queue polyA
AAAAAA...AAAAA 3'
queue polyA
5'
Maturation des ARN messagers eucaryotes dans le noyau de la cellule :
excision des introns
"coiffe"
épissage
des exons
MATURATION
ARN messager mature 5'
3'
5'
AAAAA...AAAAA 3'
Poly page 21
queue polyA
AAAAAA...AAAAA 3'
AAUAAA AAAAAAA
A
5'
queue polyA
"coiffe"
AAUAAA
5'
AAAAAAAA...AAAAAAAAOH 3'
queue polyA
"coiffe"
Un ARN
pré-messager
eucaryote
porte
une
"coiffe"
en
5'
et
une
queue
polyA en 3'.
AAUAAA
AAAAAAAA...AAAAAAAAOH
3'
5'
LA MATURATION DES ARN MESSAGERS EUCARYOTES
Poly page 21
Un ARN pré-messager eucaryote porte une "coiffe" en 5' et une queue polyA en 3'.
Comme nous l’avions dit précédemment, les ARN produits ne sont pas mature :
Ils sont composés de régions nommées «Exons» et «Intron»
Poly page 21
Après maturation, l’ARN sera utilisé par la machine de traduction (à savoir les ribosomes) et
les exons
seront conservés
à l’instar
des imessagers
ntrons qui seront seucaryotes
upprimés.
Maturation
des
ARN
La plupart des ARN messagers eucaryotes nécessitent une maturation après la transcription.
terminateur
Maturation des ARN messagers eucaryotes
unité de transcription codant une protéine
promoteur
exon
1 messagers eucaryotes
exon 2
exon 3
exon
La plupart+1
des
ARN
nécessitent
une maturation
après la transcription.
3'
4
terminateur
3'
5'
ADN 5'
intron 1
intron 3
intron 2
unité de transcription codant une protéine
promoteur
+1 exon 1
5'
ARN pré-messager
ADN
3'
exon 2
TRANSCRIPTION
intron 1
5'
exon 3
exon
4
queue polyA
3'
5'
intron 3AAAAA...AAAAA 3'
intron 2
"coiffe"
MATURATION
TRANSCRIPTION
ARN pré-messager
5' mature 5'
ARN messager
"coiffe"
"coiffe"
queue polyA
AAAAAA...AAAAA 3'
exon 1
exon 2
exon 3
MATURATION
queue polyA
AAAAA...AAAAA 3'
exon
4
Maturation des ARN messagers eucaryotes dans le noyau de la cellule : queue polyA
excision des introns
AAAAAA...AAAAA 3'
5'
épissage
des exons
ARN messager mature
Poly page 21
exon 1 exon 2
exon 3
exon
"coiffe"
4
Maturation des ARN messagers eucaryotes dans le noyau de la cellule :
excision des introns
épissage des exons
12
Poly page 21
Maturation des ARN messagers euca
Il ne faut pas seulement éliminer les introns mais il faut aussi recoller les exons.
Mécanisme
Ce processus est nommé l’«épissage».
exon 1
5'P
intron 1
site
d’épissage 5'
simplifié de l’excision-épissage
2'OH (point de branchement)
exon 2
complexe
3'OH
d’épissage
site
d’épissage 3'
exon 1
(Pas 5’P)*
5'P
intron 1
complexe
d’épissage
C’est au niveau
des sites d’épissage
que vont se dérouler les mécanismes de suppression et
2'OH
3'OH
collage. Ce processus
exonn’a
1 lieu QUE sur l’ARN puisque
exon ç2a ne fonctionne qu’avec des Riboses et
non des Désoxyriboses.
3'OH
5'P
site
d’épissage 5'
site
d’épissage 3'
complexe
d’épissage
d
intron 1
"lasso
exon 11
exon
5'P
5'P
intron 1
site
site
d’épissage
5'
d’épissage 5'
de branchement)
branchement)
2'OH (point de
exon
2
exon 2
complexe
complexe
3'OH
3'OH
d’épissage
d’épissage
site
d’épissage 3'
3'
5'P
5'P
intron 1
complexe
complexe
d’épissage
d’épissage
3'OH
3'OH
site
d’épissage 5'
5'
d’épissage
site
d’épissage 3'
d’épissage
3'
N messagers eucaryotes
é de l’excision-épissage
intron
intron 11
2'OH
2'OH
exon
exon 22
intron
1 3'OH
5'P
5'P
3'OH
3'OH
3'OH
site
site
exon
2
d’épissage
3'OH
d’épissage 3'
3'
5'P
3'OH
S’ensuit la digestion de la liaison exon 2 et intron 1 par des
5'P
site
5'P
enzymes.
d’épissage 3'
exon 1
exon 1
5'P
intron
1 en
intron
On a une liaison 5’-‐2’OH
(OH c1ar en
on
"lasso"
"lasso"
complexe
parle
d’ARN et donc de ribose et non
complexe
d’épissage
de
Désoxyribose où l’on aurait juste
d’épissage
un «exon
H»). C11’est une liaison qui
exo
ex
exon
s’effectue
d
onc
e
ntre
l
’extrémité
5
’
d
e
5'P
3'OH
5'P
3'OH5'P
5'P
l’intron et 2’OH de son dernier
Ribose
formation
formationd'une
d'uneliaison
liaison
phosphodiester
phosphodiester
exon
exon 11
exon
exon22
3'OH
3'OH
exon
exon 11 et
et exon
exon22 épissés
épissés
P
intron 1 en
"lasso"
3'OH 5'P
ex
e
site
sit
d’épissa
d’épiss
exon 2
5'P
5'P
complexe
d’épissage
3'OH
3'OH
2'OH
exon 1
exon
complexe
complexe
d’épissage
anchement) d’épissage
exon
complexe exon
1
3'OH
5'P 1
d’épissage
5'P
exon
exon 11
intr
int
exon 2
3'OH
3'OH
formation d'une liaison
Maturation
des ARN
Maturation
des
ARN messagers
messagers eucaryo
eucaryo
phosphodiester
L’épissage est assuré par un ensemble de complexes ribonucléoprotéiques appelés co
L’épissage est assuré par un ensemble de complexes ribonucléoprotéiques appelés c
spliceosome.
exon 1 est assuré
exon
L’épissage
par u2n ensemble de complexes ribonucléoprotéiques appelés
spliceosome.
collectivement
spliceosome.
Chaque
complexe,
appelé snRNP
SNURP (Small NUclear RiboNucleoProtein) con
5'PChaque
3'OH ou
appelé
snRNP
ou(Small
SNURP
(Small
NUclear RiboNucleoProtein)
co
Chaque complexe,
complexe, appelé
snRNP
ou SNURP
NUclear
RiboNucleoProtein)
contient un
ARN
et
plusieurs
protéines
exon
1
et
exon
2
épissés
ARN
t plusieurs pprotéines
rotéines.
ARN
eteplusieurs
Poly
21
L’ensemble de ce complexe (U5 U4 U6
U1 Upage
2)= Spliceosome
N messagers eucaryotes
mplexes ribonucléoprotéiques appelés collectivement
PARTICULARITE DE LA TRANSCRIPTION EUCARYOTE
L’épissage alternatif = Possibilité d’exploiter des exons de façon alternatives pour un ARN
messager.
Il va permettre à partir d’un seul gène d’avoir plusieurs protéines (N’étant pas
polycistronique, pour faire plusieurs protéines, on aura forcément besoin de plusieurs ARN)
Particularités de la transcription eucaryote
L’exemple très simpliQié ici :
L’Epissage alternatif
Particularités de la transcription eucaryote
ARN pré-messager
exon 1
5'
exon 2
exon 3
AAA...AAAA 3'
intron 2
L’Epissage
alternatif
intron 1
On a un ARN transcrit, avec un exon 1, 2 et 3 ainsi que 2 introns, l’ARN est donc non-‐mature/
ARN
pré-messager
non-‐épissé.
2 ARN messagers matures exon 1
exon 2
exon 3
exon 1
exon 2
exon 1 exon 3
AAA...AAAA 3'
5'
AAA...AAAA
5'
5'e cet ARN messager on va p
3'
intron 1obtenir
intron 2AAAA...AAA 3'
À partir d
ouvoir
deux ARN différents,
a transcription eucaryote
ARN messager 1
2 ARN messagers matures
ssage alternatif
exon 1
exon 2
.AAAA 3'
ARN messager 2
exon 2
exon 1
AAA...AAAA 3'
5'
A
5'
exon 3
ARN messager 2
exonARN
3 messager 1
AAA...AAAA
Dans ce cas là, on va éliminer
l’intron 1, l3'
’intron 2, et l’exon 3 ne sera pas pris.
intron 2
exon 1
5'
exon 3
ARN messager 2
AAAA...AAA 3'
A
AAAA...AAA 3'
A
Mais il y a le deuxième cas : on peut éliminer l’intron 1, et 2 mais ne pas prendre l’exon 2
On peut donc en fait associer les Exons de la manière que l’on veut.
La transcription
Cela signiQie qu’un même gène, qui produit donc tout le temps le même ARN non mature,
par le processus d’épissage va donner plusieurs ARN mature.
Un m
gène peut
donc coder
our plusieurs protéines.
I. ême
Modalités
générales
de la ptranscription
II. Transcription chez les Procaryotes
1. L’ARN polymérase
2. Etapes de la transcription
3. Particularités de la transcription procaryote
III. Transcription chez les Eucaryotes
La transcription
I.
II.
1. Les ARN polymérases
2. Etapes de la transcription
3. Maturation des ARN pré-messagers
4.Modalités
Particularitésgénérales
de la transcription
destranscription
ARNm eucaryotes
de la
5. Transcription des gènes ribosomiques
chez
Procaryotes
6.Transcription
Localisation cellulaire
de les
la transcription
1. L’ARN polymérase
L’Epissage
alternatif
L’Epissage
alternatif
ARN pré-messager
ARN pré-messager
5'
5'
exon 1
exon 1
exon 2
exon 2
exon 3
exonAAA...AAAA
3
3'
AAA...AAAA
intron 2
3'
intron 2
intron 1
intron 1
e la transcription eucaryote
Un exemple d’épissage alternatif :
2 ARN messagers matures
2 ARN messagersexon
matures
1
exon 2
exon 1 exon 3
exon 1
exon 2 AAA...AAAA
exon 1 exon
3
AAAA...AAA
5'
3'
5'
3'
AAAA...AAA
AAA...AAAA
ARN
messager
2
A
On
a
u
n
A
RN
d
e
d
épart,
c
e
d
ernier
p
eut
d
onc
ê
tre
m
aturé
d
e
d
ifférentes
m
anière.
ARN messager 1
5'
3'
5'
3'
ARN messager 2
A
ARN messager 1
Epissage alternatif
exon 2
1
exon 3
intron 2
AAA...AAAA 3'
1ature
exon
Dans un premier cas, lexon
’ARN m
aura 3seulement l’exon 1, 2, 3, et 4. Il codera pour la
AAAA...AAA 3'
AAA...AAAA
protéine
Calcitonin.
5'
3'
ARN messager 2
A
Par contre, le même gène, va produire d’autre protéines.
En effet son ARN sera maturé d’une autre façon :
La transcription
La transcription
I. Modalités générales de la transcription
II.
chez les de
Procaryotes
I. Transcription
Modalités générales
la transcription
1. L’ARN polymérase
2. Etapes de la transcription
1. L’ARN polymérase
3. Particularités de la transcription procaryote
2. Etapes de la transcription
Cet ARN messager
sera les
encodé
lors de la traduction comme une protéine appelée CGRP qui est
III. Transcription
chez
Eucaryotes
3.un Particularités
de
la
transcription
neuro-‐transmetteurs intervenant dans lprocaryote
a transmission de la douleur.
1. Les
ARN polymérases
III. 2.
Transcription
chez les Eucaryotes
Etapes
la transcription
On
a deux de
protéines
totalement différentes pourtant produites par un même gène.
1.Maturation
Les ARN polymérases
3.
des ARN pré-messagers
le processus
dla
e m
aturation est des
extrêmement
important.
2.Ainsi,
Etapes
de lade
transcription
4.
Particularités
transcription
ARNm eucaryotes
3.Transcription
Maturation des
pré-messagers
5.
desARN
gènes
ribosomiques
4.Localisation
Particularités
de la transcription
des ARNm eucaryotes
6.
cellulaire
de la transcription
5. Transcription
des gènes
ribosomiques
IV. Quelques
éléments
de régulation
de la transcription
6.
Localisation
cellulaire
de
la
transcription
1. Régulation chez les Procaryotes
II. Transcription chez les Procaryotes
transcription
a transcription
Régulationéléments
chez les Eucaryotes
IV.2.Quelques
de régulation de la transcription
rocaryotes
1. Régulation chez les Procaryotes
n
2. Régulation chez les Eucaryotes
ocalisation
des
ribosomiques
LOCALISATION
DES gènes
GÈNES RIBOSOMIQUES
Les gènes ribosomiques 45S sont localisés au niveau du nucléole
Les gènes (organisateurs
ribosomiques snucléolaires)
ont localisés au niveau du nucléole chez les eucaryotes.
Sur des régions de chromosomes appelés «Organisateurs nucléolaires»
réticulum
endoplasmique
télomère
chromosome
centromère
14
15
21
13
22
nucléole
télomère
ribosomes
Pore nucléaire
lamina
nucléaire
nucléoplasme
enveloppe
nucléaire
Chez l’homme, on a 5 chromosomes qui portent les Organisateurs nucléolaires.
Sur ces 5 chromosomes (13,14,15,21,22) se répartissent 250 gènes qui codent pour l’ARN
chromosomique 45S.
Sur le chromosome 14, les gènes codants sont redondants et en tandem (Car l’un après l’autre,
ranscription
gènes
on a donc sur des
un chromosome
une iribosomiques
nformation qui se répète)
terminateur
promoteur
Comment sont transcris ces gènes ribosomiques ?
unité de transcription
ADN intercalaire
Ils sont uniquement transcrit par les organisateurs nucléolaires (Sauf l3'e 5S)
5'
5'
Pendant toute l’interphase ils sont extrêmement redondants
(transcris plusieurs fois) et
ARN polymérase I
3'
constamment transcris (1 millions de ribosomes nécessaires pour une seule cellule animale)
ARN pré-ribosomique 45S
es ribosomiques
5'
5'
Transcription des gènes ribosomiques
promoteur
ADN
terminateur
unité de transcription
promoteur
ADN intercalaire
5'
3'
3'
5'
5'
3'
brin transcrit
ARN polymérase I
5'
ARN pré-ribosomique 45S
5'
protéines ribosomiques
5'
Complexes de transcription d’ARN nucléolaires
d’ovocytes d’amphibiens
Chaque unité de transcription représente un «arbre de Noël» et entre chaque «arbre de Noël»
on a un ADN intercalaire. Ces deux arbres représentes le même gène.
C’est l’ARN polymérase I qui transcrit l’ADN ribosomique.
Sur un même brin on a de nombreuses de séquences identiques qui codent pour la même
protéine. (Cf le schéma ci dessus)
Organisation des gènes ribosomiques
Mais l’ARN 45S n’existe pas dans une cellule eucaryote, il n’existe que les ARN 5,8S 18S etc.
Les Et
ARN
ribosomiques
18S uetne
5,8S
sont transcrits
d’unARN.
précurseur commun.
bien
cet ARNr 45s 28S,
va subir
maturation,
et va dsous
onner forme
d’autres
ARN
pré-ribosomique
Ce n’est pas un épissage d’ARN
messager,
c’est une 45S
tout autre maturation.
(13 000 nucléotides)
ARN espaceur
5'
3'
Cette maturation va éliminer toute les parties inutiles.
5'
3'
5'
ARNr 18S
3'
ARN 32S
(2 500 nucléotides)
5' 3' 5'
3'
ARNr 5,8S
ARNr 28S
(160 nucléotides)
(4 800 nucléotides)
5'
3'
5'
3'
5'
ARNr 18S
3'
ARN 32S
(2 500 nucléotides)
5' 3' 5'
3'
ARNr 5,8S
ARNr 28S
(160 nucléotides)
(4 800 nucléotides)
L’ARN pré-‐ribosomique 45S est d’abord découpé en ARNr 18S et 32S.
Le 32S va
être de
à nclivage
ouveau des
découpé
pour obtenir
deux autres ARNr 5,8S et 28S.
: site
endonucléases
spécifiques
On obtient \inalement 3 ARN : 18S-‐28S-‐5,8S.
Jusqu’ici on a toujours pas parlé de l’ARR 5S :
Ce dernier est synthétisé dans le nucléoplasme et non pas dans le nucléole.
Il est synthétisé par l’ARN polymérase 3 (ARNPol III) alors que les autres ARN ribosomiques
sont synthétisés par le I et dans le nucléole depuis l’ARN 45S.
La transcription
Comment se présentent les ribosomes chez les procaryotes et les eucaryotes ?
I. Modalités générales de la transcription
Pour les eucaryotes :
Le ribosome
entier
80S Avec deux sous unités 60S et 40S
II. Transcription
chez
les=Procaryotes
Les Arn
ribosomaux ( 5S---5,8S---28S)entrent dans la constitution de la grande sous unité
1. L’ARN
polymérase
du
ribosome(60S),
et les 18S entrent dans la petit sous unité du ribosome (40S)
2. Etapes de la transcription
3. Particularités
de la transcription
procaryote
Pour les procaryotes
:
le ribosome
entier
70S avec deux sous unités de 50S et 30S
III. Transcription
chez
les= Eucaryotes
S 23polymérases
S pour la grande S.U (50S) et 16S pour la petite S.U (30S)
1. Les5ARN
2. Etapes de la transcription
3. Maturation
des ARN
pré-messagers
Les ribosomes
s’assemblent
dans le nucléole sous forme de pré-‐ribosomes en grande et
4. Particularités
la transcription
desàARNm
eucaryotes
petites sous de
unités,
puis ils migrent
l’extérieur
du nucléole puis du noyau et le ribosome
devient totalement
actif ribosomiques
une fois dans le cytoplasme..
5. Transcription
des gènes
6. Localisation cellulaire de la transcription
IV. Quelques éléments de régulation de la transcription
1. Régulation chez les Procaryotes
2. Régulation chez les Eucaryotes
16
Transcriptions
Pol. I polymérase I : ARNr 45S
Pol. II polymérase II : ARNm
Pol. III polymérase III : ARNt, ARNr 5S
Export ARNt
Acides Aminés
ARNt-AA
EN
pore
ARNm
ARNt
PolIII
euchromatine
Ribosome
80S
nucléole
épissage
Maturation
de l’ARNm
Export ARNm
PolII
ARN prémessager
PolI
ARNr45S
Petite sous-unité
40S (ARNr18S + P)
Grande sous-unité
60S (ARNr5+5,8+28S
+P)
Cytoplasme
Synthèse
des protéines
ARNr5S
Transcription de
l’ARNr45S
Maturation de
l’ARNr45S
Composant granulaire
= accumulation des
particules
préribosomiques
PolIII
Export 40S
Exportations :
hétérochromatine
1 chromosome avec
organisateur
nucléolaire
Synthèse protéique
Ac.am.
ARNt
lamina
Importations :
ARNm(+p)
ARNt
pSUr (p)
gSUr (p)
protéines NLS dont
p. ribosomiques,
Pol I, II, III
P maturation des ARNm
Export 60S
La transcription des ARNm peut être contrôlée par des séquences contiguës au promoteur.
Ces séquences sont situées au tout début du gène et appelées séquence «cis-‐régulatrices».
Régulation procaryote
Organisation 1 d’un gène procaryote codant une protéine
unité de transcription
opérateur promoteur
terminateur
ADN
1- La protéine de régulation est un activateur (contrôle positif de la transcription)
ARN polymérase
gène de l'activateur
opérateur promoteur
AMPc
activateur inactif
activateur actif
L’activateur activé permet la fixation de l’ARN polymérase sur le promoteur :
activation de la transcritption.
Régulation procaryote
Ici l’activateur aurait un
rôle sur le facteur TFIID. Il
stimule la formation du
complexe de préinitiation.
La région opérateur peut
se lier soit à un répresseur
soit à un activateur et ainsi
activer ou non la fixation
du facteur TFIID.
L’activateur activé permet la fixation de l’ARN polymérase sur le promoteur :
activation de la transcritption.
Régulation procaryote
Organisation 1 d’un gène procaryote codant une protéine
unité de transcription
opérateur promoteur
terminateur
ADN
2- La protéine de régulation est un répresseur (contrôle négatif de la transcription)
ARN polymérase
gène du répresseur
promoteur opérateur
lactose
répresseur
actif
répresseur inactif
Le répresseur empêche la fixation de l’ARN polymérase sur le promoteur :
répression de la transcritption.