Comment aligner une séquence protéique .pdf



Nom original: Comment aligner une séquence protéique.pdf
Titre: Présentation PowerPoint
Auteur: yasmine

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Comment aligner une séquence
protéique ??!
Cherchez la séquence et ses homologues puis
effectuer l’alignement

1-Tout d’abord chercher la séquence fasta de la protéine que vous voulez aligner

Tapez le nom de la
protéine

Ce n’est pas forcément sur la base de données Unipot (vous pouvez effectuer une recherche sur d’autres BDD)

Exp

Choisissez Un

Cliquez Ici

C’est la séquence
fasta

Copier cette séquence

1-Allez vers le site NBCI (cherchez Blastp)

Voila !

Coller la séquence fasta ici

choisissez la banque contre
laquelle vous voulez aligner

Cliquez ici

Résultats

Résultats

Résultats

Vous pouvez trouvez le rapport
taxonomique des séquences
trouvées ici

Voila le rapport taxo
Résultats

Vous cochez les séquences
homologues de la séquence protéique

Résultats

Résultats

Télécharger les fomats fasta
des séquences homolgues

Voila ^^

Copier

2- allez vers EBI

Coller + la 1ere séquence protéique
Séquence de demarrage

Voila

Cliquez ici

Veuillez patienter un peu !!
Le logiciel en train de traiter
les séquence

Résultats

Résultats

Les * sont les zones conservatives
Les : semi conservatives
Les . Non conservatives

Donc, plus il y a des Etoiles plus que les séquences sont étroitement similaires
Et cela est clair dans ce cas là ^^

Bon courage

KERMEZLI Yasmina
*Biosignalisation callulaire et moléculaire,Immunologie (Université Saad Dahleb de blida )

*Bioinformatique (Equipe de recherche Bioinformatique et génomique BHK)
*Dévloppeur Web (Higer Institute Of technology Information Ibnrochd)




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