Zidane Audouze CVetautres .pdf



Nom original: Zidane-Audouze-CVetautres.pdfTitre: Zidane-AudouzeAuteur: Karine Audouze

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Curriculum  Vitae  
ÉTAT  CIVIL  
 
NOM  :    AUDOUZE            Prénom  :  Karine  
Age  :  44  
Adresse  professionnelle  :  Université  Paris  Diderot  -­‐  Inserm  UMRS973  
                                 
 
           Bât.  Lamarck  A,  5é  étage,  porte  513  
           35  rue  Hélène  Brion  
           75205  Paris  Cedex  13  
Adresse  email  :  karine.audouze@univ-­‐paris-­‐diderot.fr  
 
FORMATION  UNIVERSITAIRE  
 
2001:  Thèse  en  Chimie  -­‐  Bioinformatique  -­‐  mention  très  honorable  
Université  d´Orléans  -­‐  Laboratoire  de  Chimiométrie,  dirigé  par  Prof.  J.  Chrétien    
 
Titre:  Validation  de  nouvelles  stratégies  de  database  mining  appliquées  à  l´olfaction  
 
 
1997:  DEA  de  biologie  et  biophysique  moléculaire  et  cellulaire  -­‐  Université  d´Orléans  
 
Auparavant  Maitrise  et  Licence  en  Biochimie  et  DEUG  SdV  -­‐  Université  d´Orléans.  
 
EXPÉRIENCES  PROFESSIONNELLES  SCIENTIFIQUES  
 
Présent  -­‐  2014:  MCU  -­‐  Université  Paris  Diderot  -­‐  France  -­‐  Laboratoire  MTi,  dirigé  par  B.  
VILLOUTREIX.    Thème:  Intégration  de  données  et  analyses  statistiques  appliquées  aux  petites  
molécules  chimiques.  
 
2014-­‐2007:  Professeur  assistant  puis  associé  -­‐  Université  Technique  du  Danemark  -­‐    
Danemark,  sous  la  direction  du  Prof.  S.  Brunak.  Thème:  Intégration  de  données  -­‐  
Développement  de  nouvelles  méthodes  d´analyse  de  données  chimiques,  biologiques,  
toxiques  et  cliniques.  
 
2007-­‐2001:  Chercheur  en  chimie  médicinale  -­‐  Industries  pharmaceutiques  (NeuroSearch  A/S,  
Bioimage  A/S  et  Arpida  A/S)-­‐  Danemark.  Thème:  Développement  de  bases  de  données    -­‐  
Identification  et  optimisation  in  silico  de  molécules  à  visée  thérapeutique.  
 
EXPÉRIENCES  D’ENSEIGNEMENT  
 
Présent  -­‐  2014:  Université  Paris  Diderot  -­‐  Public  L2  à  M2.    
Responsable  du  cours  ChémoInformatique  (M1  in  silico  Drug  Design)  et  Biostatistiques  et  R  
(M1  Environnement  &  Géobiologie).  
 
2014-­‐2009:  Université  Technique  du  Danemark  -­‐  Public  L2,  L3,  masters  et  doctorants  
Responsable  du  cours  Introductory  project  work  :  Human  life  science  engineering  
Participation  à  divers  cours  (Chemoinformatics,  Nutrigenomics…)  
 
EXPÉRIENCES  D’ENCADREMENT  
 
2016-­‐  2015:  Université  Paris  Diderot  -­‐  Supervision  d’étudiants:  2  en  M2-­‐  BioInformatique,  2  
en  M1-­‐  in  silico  Drug  Design  et  4  en  L3-­‐BioInformatique.  

 
2015-­‐   2009:   Université   Technique   du   Danemark   -­‐   Co-­‐superviseur   de   2   doctorants   -­‐  
Supervision  de  2  post-­‐doctorants,  d’un  doctorant  (3  mois),  de  7  L3,  et  d’un  master.  
 
CONTRATS  SCIENTIFIQUES  
 
2017-­‐2013:   Participation   en   tant   que   scientifique   à   un   projet   international   financé   par  
´National  Institute  of  Environmental  Health  Sciences´(NIH-­‐US)  :  Glucose  Metabolism  in  Adults  
Prenatally  Exposed  to  Diabetogenic  Pollutants  (EH021477).    
 
2016-­‐2015:   Participation   à   un   projet   national   récemment   financé   par   l’ANS-­‐France   (Action  
Nouvelle  Soutenue  –  INRA),  projet  CAMeIIA.  
 
2014-­‐2007:   Implication   en   tant   que   scientifique   dans   3   projets   européens  :   BioSim-­‐FP6,  
DEER-­‐FP7   et   eTOX-­‐IMI,   et   dans   4   projets   Danois:   Center   for   Disease   Systems   Biology,   EDC,  
GENDINOB  et  COCKTAIL  .  
 
AUTRES  RESPONSABILITÉS  SCIENTIQUES  &  PRIX  
 
2014-­‐2011:   membre   de   l´organisation   du   workshop   annuel   ´Translational   Informatics’   à  
l’Université  Technique  du  Danemark.    
 
2011:  European  Society  of  Toxicology  In  Vitro  -­‐  Prix  de  la  meilleure  présentation  poster.  
 
2010:  membre  du  conseil  scientifique  de  la  conférence  ´Food-­‐drug  synergies´  à  Copenhague.    
 
Divers  :   membre   du   comité   éditorial   du   journal   international   ‘Frontiers   in   Toxicogenomics’  
(depuis  2011).  Evaluatrice  pour  plusieurs  journaux  dont  ´International  Journal  of  Andrology’  
et  ‘Bioinformatics’.  
 
 
PUBLICATIONS  
 
 
Nombre  total   premier  
dernier  auteur   avec  étudiants  
auteur  
encadrés  
Articles  acceptés  dans  des  
28  
8  
3  
7  
revues  internationales  à  
comité  de  lecture  
Autres  articles  /  Chapitre  livre   6  
 
 
 
Articles  soumis    
2  
 
 
2  
 

Liste   des   publications   des   3   dernières   années  
(2014-­‐2016)  
 

1. Krysiak-­‐Baltyn  K,  Nordahl  PT,  Audouze  K,  Jørgensen  N,  Angquist  L,  Brunak  S.  
Compass  :  a  hybrid  method  for  clinical  and  biobank  data  mining.  J.  Biomed.  Inform.  
2014  47  :160-­‐170.  
2. Kongsbak  K,  Vinggaard  AM,  Hadrup  N,  Audouze  K.  A  computational  approach  to  
mechanistic  and  predictive  toxicology  of  pesticides.  ALTEX.  2014  ;31(1)  :11-­‐22.  
3. Kongsbak  K,  Hadrup  N,  Audouze  K,  Vinggaard  AM.  Applicability  of  computational  
systems  biology  in  toxicology.  Basic  Clin.  Pharmacol.  Toxicol.  2014  Feb  16.  
4. Wohlfahrt-­‐Veje  C,  Audouze  K,  Brunak  S,  Antignac  JP,  le  Bizec  B,  Juul  A,  Skakkebæk  
NE,  Main  KM.  Polychlrorinated  dibenzo-­‐p-­‐dioxins,  furans,  and  biphenyls  
(PCDDs/PCDFs  and  PCBs)  in  breast  milk  and  early  chilhood  growth  and  IGF1.  
Reproduction.  2014.  Mar  2  ;  147(4)  :391-­‐9.  
5. Audouze  K,  Tromelin  A,  Le  Bon  AM,  Belloir  C,  Petersen  RK,  Kristiansen  K,  Brunak  S,  
Taboureau  O.  Identification  of  odorant-­‐receptor  interactions  by  global  mapping  of  
the  human  odorome.  PLoS  One.  2014  Apr  2;9(4):e93037.  
6. Borkowski  K,  Wrzesinski  K,  Rogowska-­‐Wrzesinska  A,  Audouze  K,  Bakke  J,  Petersen  
RK,  Haj  FG,  Madsen  L,  Kristiansen  K.  Proteomic  analysis  of  cAMP-­‐mediated  signaling  
during  differentiation  of  3  T3-­‐L1  preadipocytes.  Biochim  Biophys  Acta.  2014  Aug  
22;1844(12):2096-­‐2107.  
7. Hao  Q,  Yadav  R,  Basse  AL,  Petersen  S,  Sonne  SB,  Rasmussen  S,  Zhu  Q,  Lu  Z,  Wang  J,  
Audouze  K,  Gupta  R,  Madsen  L,  Kristiansen  K,  Hansen  JB.  Transcriptome  profiling  of  
brown  adipose  tissue  during  cold  exposure  reveals  extensive  regulation  of  glucose  
metabolism.  Am  J  Physiol  Endocrinol  Metab.  2015  Mar1  ;308(5)  :E380-­‐92.    
8. Skov  K,  Kongsbak  K,  Hadrup  N,  Frandsen  HL,  Svingen  T,  Smedsgaard  J,  Audouze  K,  
Eklund  AC,  Vinggaard  AM.  Exposure  to  perfluorononanoic  acid  combined  with  a  low-­‐
dose  mixture  of  14  human-­‐relevant  compounds  disturbs  energy/lipid  homeostasis  in  
rats.  Metabolomics.  2015.  S11306-­‐015-­‐0802y.  
9. Audouze  K,  Taboureau  O.  Chemical  biology  databases  :  from  aggregation,  curation  to  
representation.  Drug  Discovery  Today:  Technologies.  2015.  14  :25-­‐9.  
10. Kugathas  S,  Audouze  K,  Ermler  S,  Orton  F,  Rosivatz  E,  Scholze  M,  Kortenkamp  A.  
Effects  of  common  pesticides  on  prostglandin  D2  (PGD2)  inhibition  in  SC5  mouse  

sertoli  cells,  evidence  of  binding  at  the  COX-­‐2  active  site,  and  implications  for  
endocrine  disruption.  Environ  Health  Perspect.  2016.  124(4):452-­‐9.  
 

Liste  des  encadrements  doctoraux  des  5  
dernières  années  
 
-­‐

U.P.   Jacobsen:   Co-­‐superviseur   avec   O.   Taboureau   (Université   Technique   du  
Danemark).  Les  travaux  du  doctorant  U.P.  Jacobsen  (soutenance  prévue  en  2016)  sur  
la   ‘Translational   informatics   in   Toxicology’   ont   donné   lieu   a   3   publications   (J  
Pharmacogenom   Pharmacoproteomics   2012,   Nucleic   Acids   Res.   2013,   Bioinformatics.  
2013,  dernier  auteur).    

 
-­‐

K.   Kongsbak  :   Co-­‐superviseur   avec   AM.   Vinggaard   (Université   Technique   du  
Danemark).  Les  travaux  de  la  doctorante  K.  Kongskab  en  collaboration  avec  l’Institut  
national  Danois  de  l’alimentation  (thèse  intitulée  ‘Integrative  systems  biology  applied  
to   toxicology’   soutenue   en   2015)   ont   donnés   lieu   à   3   publications   (ALTEX.   2014,  
dernier  auteur,  Basic  Clin.  Pharmacol.  Toxicol.  2014,  Article  26.  Metabolomics.  2015).    

 
 
 


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