Doc3 AA et Protéines .pdf
Nom original: Doc3 AA et Protéines.pdfTitre: الأحماض الأمينية والبروتينات Amino acides et proteines تعتبر البروتينات أهم المركبات الحيوية نظرا للأدوار الأساسية التي تقومAuteur: karim
Ce document au format PDF 1.5 a été généré par Microsoft® Word 2013, et a été envoyé sur fichier-pdf.fr le 24/12/2016 à 14:24, depuis l'adresse IP 105.98.x.x.
La présente page de téléchargement du fichier a été vue 890 fois.
Taille du document: 1.5 Mo (45 pages).
Confidentialité: fichier public
Aperçu du document
األحماض األمينية والبروتينات
Amino acides and proteins
تعتبر البروتيناات هماا المراتاات الحيوياة نلا ار لااألوار األااااية التاي تلاوا اي ال .ياا الحياة
تتواج ااأل البروتين ااات ااي ا ااي ال .ي ااا الحي ااة و ااي ا ااي األجا اتاف ال .وي ااة وتا ا أل هألوا ار م.ت ااة
اإنتيمات وبروتينات النلي ،الت.تين ،التغذية ،الحراة ،مرمونات
إلخ
تحت ااو البروتين ااات هااا ااا ك اا ،كناس اار الهرب ااون ،األها ااجين ،ال ي ااألروجين ،النت ااروجين
والهبري اات ،ام ااا يحت ااو تعنا ا ا ك اا ،كناس اار ه .اارر م ااي الحألي ااأل ،ال اا ا ور ،والنح ااا
،
التنك
والبروتينات مي جتيئات ابيرة تتهون من كألأل ابيار مان الوحاألات األااااية تاام ،األحمااض
األمينية (ه ه) Amino Acides
األحماض األمينية
تتهون من مجموكة همين ومجموكة اربوااايي وذرة مياألروجين وا اا ة جانبياة ( )Rمرتتطاة
كن طريق ذرة اربون تام- ،اربون ألن اا مجااورة لمجموكاة الهربوااايي تهاون مجموكاة
الهربواايي متأينة وحام ة لشحنة االتة بينما تهون مجموكة األمين حام ة لشحنة موجتة
R
يتواجااأل ااي البروتينااات ك اااألة كشاارون ( ) 20حمن ااا هميني ااا هااااايا ت.ت ااي يمااا بين ااا ااي
الا ا ة الجانبية ( ، )Rمذه الا اا ة تحاألأل .ساائل الحماض األميناي الهيميائياة وال يتيائياة
م ي نوع الت اك ت والذوتان
تامية األحماض األمينية
16
لهي حمض هميني ااا التيني .ال وااا م.تسر ماون من ال
ة حروف األولا( ،إال اي
تعااض الحاااالت) وااااا م.تساار ماااون ماان حاارف واحااأل وياااتعمي كاااألة االاااا الماااون ماان
ااة هحاارف .اسااة كنااأل اتاتااة تا اااي األحماااض األمينيااة ااي البروتينااات يحتااو الجااألو
الماوالي ك اا ،ها اماف األحماااض األمينيااة األاااااية وتعااض مميتات ااا التااي اااوف يااأتي ا شااارة
إلي ا الحلا ي مذا التاب
أسماء وأقسام وبعض خصائص األحماض األمينية المتواجدة في البروتينات
التواجد في
البروتينات
درجة الكراهة
للماء
قيم pK
pHi
pKR
pK2
pK1
و.ج
األسماء
المختصرة
الحمض األميني
متعادلة أليفاتية
متعادلة عطرية
متعادلة محبة للماء
قاعدية
حامضية
تلايا األحماض األمينية
من اااك ك ااألة ط اارا لتلا اايا األحم اااض األميني ااة همم ااا ت ااك الت ااي تعتم ااأل ك اا ،محت ااور الا اا ا ة
الجانبيااة ماان مجموكااات اكأليااة هو حامنااية ،وتلاااا األحماااض األمينيااة تتعااا لااذلك إلاا3 ،
17
ه ااا هاااية:
-1هحمااض همينياة اكألياة وتشامي 3ه ه ماي Lys , Arg , His :تحتاو ماذه األحمااض
ك ،مجموكة اكألية ي الا ا ة الجانبية وتحمي شحنة موجتة كنأل pHالمتعاأل
-2هحماااض همينيااة حامنااية وتشاامي 2ه ه مااي Glu , Asp :وتتمياات مااذه األحماااض
بإحتوائ ااا ك اا ،مجموكااة حمنااية ااي الا اا ة الجانبيااة وتحمااي بااذلك شااحنة موجتااة كنااأل pH
المتعاأل
أحماض أمينية متعادلة أليفاتية
أحماض أمينية متعادلة عطرية
أحماض أمينية حامضية
18
أحماض أمينية متعادلة قطبية (محبة للماء)
أحماض أمينية قاعدية
-3هحماااض همينيااة متعاأللااة وتشاامي 15ح ه التا يااة ،وتلاااا مااذه األحماااض األمينيااة بااألورما
إل ،هحماض همينية هلي اتية ،احولية ،اريتية ،كطرية (هروماتية)
إلخ
ااأل تلاااا األحماااض األمينيااة حاااب اا وا ا ااي الماااف إلاا ،محتااة ل ماااف ( )Hydrophylesو
اارمااة ل ماااف ( )Hydrophobesامااا ت.ت ااي األحماااض األمينيااة ااي ألرجااة حب ااا هوارامت ااا
ل مااف ،نجاأل ه ه الهارماة جاألا م اي Val , Leu , Ile , Pro , Pheو األ اي ا ارماة ل مااف
م اي Cys , Metوالمحتاة ل مااف باألرجات م.ت اة م اي Ser, Thrتا ناا ة إلا ،األحمااض
األمينية اللاكألية والحامنية يعبر كن ألرجة الهرامة ل ماف كن طريق ا ا ر ماي تلايا موجتاة
(هحماض همينية اارماة ل مااف) هو ااالتة (هحمااض همينياة محتاة ل مااف) ،ماذه ال.ساائل ل اا
هممية ابيرة ي الح اظ ك ،ااتلرار بنية البروتينات اما ايأتي ا شارة إليه الحلا
بعض خصائص األحماض األمينية:
النشاط الضوئي:
اي األحماض األمينياة ماكاألا الج يااين ل اا نشااي ناوئي وذلاك الحتوائ اا ك ا ،ذرة ارباون
غير متنالرة (التي ترتتط تأربع مجموكات م.ت ة) ،ويحتو Thrو Ileك ا ،ذرتاي ارباون
غياار متنااالرتين امااا تمتااات األحماااض األمينيااة بوج اوأل سااورتين متنااالرتين مرتيااا Dو L
ك ،حاب ونع مجموكة األمين إلا ،اليماين هو اليااار ،الساورة Lماي التاي تتواجاأل كااألة
19
نمن ترايب البروتينات الطبيعية
الشحنة:
تهون األحمااض األمينياة اي المحالياي ذات pHالمتعااأل ك ا ،شااي هياون ناائي اللطبياة
( ion
dipolar
هو ، )Zwitterionوته ا ااون مجموك ا ااة األم ا ااين موجت ا ااة الشا ا ااحنة
( )NH3+ومجموكااة الهربواااايي اااالتة الشااحنة ( )COO-تتغياار مااذه الشااحنة بتغياار pH
الوا ااط ،ام ااا تحت ااو األحم اااض األميني ااة اللاكألي ااة والحامن ااية ك اا ،ش ااحنات إنا اا ية ااي
الا ا ة الجانبية ()R
سلوك األحماض
سلوك القواعد
20
تاا ا ك األحم اااض األميني ااة اا ا وك األحم اااض (تعط ااي بروتون ااات) واا ا وك اللواك ااأل (تها ااب
بروتونات) وذلك تتعا لألرجة pHالواط ،لذلك تام ،األحماض األمينية
معايرة األحماض األمينية ()Titration
-1معااايرة الج ياين : Gly
كنااأل تحنااير مح ااو Glyكنااأل ( pH=1مح ااو Hcl 0.1كيااار ) ااا معايرتااه بإنااا ة
اكألة وية م ي NaOHتألريجيا و يا
pHالمح و نحسي ك ،منحني يونا الع اة
بااين ماا ئااات (هحجاااا) اللاكااألة الملا ااة (محااور
) و pHالواااط (محااور ع ) الشاا ااي
3-2ينلا ااا المنحن ااي إل اا ،م اارح تين تم ااي األولا ا ،مع ااايرة مجموك ااة الهربواا اايي وال اني ااة
مجموكااة األمااين كنااأل بألايااة المعااايرة pH=1ياااون ح ه ذو شااحنة موجتااة ( )1ناتجااة ماان
مجموكة األمين ( )NH3
كن ا ااأل إن ا ااا ة اللاك ا ااألة تب ا ااأله مجموك ا ااة الهربواا ا اايي ا ااي الت ا ااأين ،وكن ا ااأل مرح ا ااة متوا ا ااطة
( )pH=pKتهااون مجموكااة الهربواااايي ااأل تأيناات بناااتة % 50تمواس ا ة المعااايرة تتااأين
مجموكة الهربواايي ا ياا ويسات الحماض األميناي ناائي التاأين ومتعااأل
ا ربائياا وتاام،
مذه النلطاة بنلطاة التعااأل اله رباائي )Isoelectric point) pHiتمواسا ة المعاايرة اي
المرح ااة ال اني ااة تب ااأله مجموك ااة األم ااين ااي ل ااأل البروت ااون وكن ااأل pH=9.60يتا اااور تراي اات
الحمض نائي التأين والحمض االب الشحنة (تأين % 50من مجموكاة األماين) ه كناألما
ياا ااون pH=pKلمجموكا ااة األما ااين تنت ا اا ،المعا ااايرة كنا ااألما تتا ااأين مجموكا ااة األما ااين ا يا ااا
( pH=12تلريتا) ،ياون الحمض األميني ي السورة االتة الشحنة ()1-
يما اان حا اااب نلط ااة التع اااأل اله رب ااائي ل ا ا Glyواألحم اااض المتعاألل ااة األ .اارر امتوا ااط
حاااابي لليمتااي اباات التااأين لمجمااوكتي األمااين والهربواااايي وتااااو
5.97
21
ااي حالااة الج ياااين
pHi
+
مكافئات H
-
مكافئات OH
مكافئات OH
+
مكافئات H
امااا يمااان االاااتنتا هن منحناا ،الج ياااين يحتااو ك اا ،منطلتااين يمااان هن ياااون ي مااا
امح و منلا وذلك حو نلطتي pK
ن حااأ هن Glyياااون موجااب الشااحنة كنااألما ياااون pHهسااغر ماان ، (pH<pHi ) pHi
بينما ياون ااالتا اي pH>pHiوتاتألاأل الشاحنة الموجتاة هو الااالتة ا ماا ابتعاألنا كان نلطاة
التعاااأل اله ربااائي ،وتتاراوح شااحنة Glyبااين 1ااي الواااط الحامنااي اللااو إلاا 1- ،ااي
الواط اللاكأل اللو
حاب مذه اللاكألة يمان تحأليأل نوع الشحنة التي يحم ا الحمض األميني كناأل ه نلطاة مان
pHتعااأل ملارنت ااا بنلطااة pHiمااذه المع ومااات ذات همميااة تطبيليااة ااي سااي األحماااض
األمينيااة ،حياام هن م.اااليط األحماااض األمينيااة يمااان س ا ا حاااب اااركت ا ااي المجااا
اله ربائي هو حاب يا pHiي كموأل التتاأل األيوني
22
تعطي األحماض األمينية المتعاأللة التا ية منحنيات معايرة شبي ة تمنحن ،معايرة األالنين
-2معايرة حمض الجلوتاميك :Glu
نل ا ار الحتوائااه ك اا ،مجموكااة اب ااة ل تااأين ااي الا ا ا ة الجانبيااة ااإن منحناا ،معااايرة Glu
ياااون هه اار تعليااألا ويحتااو ك اا،
التأين pK
ااة م ارحااي تتااأين المجموكااات ال
ااة حاااب اايا اباات
pHi
مكافئات OH
كيف يمكن حساب نقطة التعادل الكهربائي في هذه الحالة ؟
ال يمااان حاااا ب ااا إال تعااأل معر ااة ترتيااب تااأين المجموكااات ال ا م وتالتااالي معر ااة السااورة
23
التااي ياااون ي ااا الحمااض األمينااي متعاااأل ا ربائيااا ،يمااان تعااأل ذلااك حااااب متواااط يمتااي
pKالتي تلع ك ،جانبي نلطة pHiي حالة Gluيمان حااب pHiاما ي ي:
pHi = 1/2 (pK1 + pKR)= 1/2 (2.19 + 4.25) =3.22
ه هن pHiما ااي متواا ااط يمتا ااي pKلمجما ااوكتي الهربوااا اايي ي حا ااأ هن ما ااذه الليما ااة
من .لة مما يأل ك ،هن حمض Gluياون متعاأل ا ربائيا ي الواط الحامني
-3معااايرة الحمااض األمينااي :Hisيشااته ااي الشاااي منحناا ،معااايرة Gluوي.ت ااي كنااه ااي
ترتيااب المجموكااات المتأينااة وتحاااب يمااة pHiباان
:His
اللاكااألة الااااتلة وتااااو
ااي حالااة
pHi = 1/2 (pKR + pK2)= 1/2 (6.00 + 9.17) =7.59
تبااين مااذه الليمااة هن Hisياااون متعاااأل ا ربائيااا ااي الواااط اللاكااأل ،و تهااون األحماااض
األمينيااة اللاكأليااة األ.اارر متعاأللااة ااي pHاكااأل هك اا ،وذلااك تتعااا للاايا pKل مجموكااات
اللاب ة ل تأين ،م
ي حالة Argنلطة pHi= 10.76
طرق فصل األحماض األمينية
هو .طااوة ااي أل اراااة ترايااب البااروتين مااي تح ي ااه إلاا ،هحماااض همينيااة ح ارة ومعر ااة نااوع
وامية اي حمض من ا مناك كألة طرا ل سي األحماض األمينياة ناذار من اا مناا طاريلتين
ا يا ارة ا ا ااتعما وذات عالي ااة ابيا ارة ااي ال س ااي مم ااا :ال جا ارة اله ربائي ااة و اروماتوغ ار ي ااا
التتاأل األيوني ،وتعتماأل ماتاان الطريلتاان ك ا ،ناوع و اوة الشاحنة اله ربائياة اي ااي حماض
هميني كنأل ألرجة pHال سي
-1ال جرة اله ربائية:
تطورت من ا حاليا طر ا ا يرة ومتنوكاة .اساة ماع تطاور طارا ساي طاع مان األحمااض
النووية ADNو ، ARNوهتاط مذه الطرا مي ال جرة اله ربائية ل .يط
األحماض األمينية ك ،الورا اماألة حام ة
يتهون ج ات ال جرة اله ربائية من حوض يحتو
24
،طر يه ك ،غر تين تحتويان ك ،
مح او ماانلا ،ويوجاأل ااي الغر اة األولاا ،طاب ا ربااائي ااالب و اا ،ال انياة طااب موجااب
تتسي الغر تان كن طريق جار ماون من شريط ورا ترشي مب ي بن
المح و المنلا
تااتا كم يااة ال سااي بونااع نلطااة ماان م .ااوي األحماااض األمينيااة الماراأل سا ا ااي منتسااي
الشا اريط ال ااور ي ااا يطب ااق مج ااا ا رب ااائي ذو ولطي ااة ابت ااة تع ااأل رب ااط األاا ا ك المتسا ا ة
ت اااللطبين (الا ااالب والموج ااب) تمول ااأل ا رب ااائي تتح اارك األحم اااض األميني ااة ألا .ااي المج ااا
اله ربااائي تاااركات م.ت ااة وبإتجاااه م.ت ااي حاااب نااوع و ااوة الشااحنة التااي ت.ت ااي امااا رهينااا
بإ.ت ف ألرجة pHالواط (المح و المنلا)مما ي أل إل ،س ا كن تعن ا
لتحأليااأل ماااان األحماااض األمينيااة ك اا ،ش اريط الااورا تعااأل س ا ا يج ااي الش اريط الااور ي ااا
يرش تااشي منااب لت وين التلع المحتوية ك ،األحماض األمينية ومن هما ماذه الهواشاي
ياااتعمي ااشااي النن يااألرين ninhydrineالااذ ي ااون األحماااض األمينيااة ب ااون بن اااجي ،
ويتا تحأليأل نوع األحماض األمينية تملارنت ا تالعينات المع ومة والمعام ة بن
الطريلة
-2كروماتوغرافيا التبادل األيوني:
تطااورت من ااا حاليااا طر ااا ا ي ارة ومتنوكااة ل سااي العأليااأل ماان المراتااات ال امااة حيويااا م ااي
البروتينات
تعتم ااأل م ااذه الطريل ااة ك ا اا ،كم ي ااة التج اااذب ب ااين الشا ااحنات المتعاها ااة تم ااا هن األحمااااض
25
األمينية و البروتينات تهون مشحونة إنه يمان س ا ب ذه الطريلاة تاتا كم ياة ال ساي اي
كم اوأل مم ااوف تمتتاااأل هيااون( ،إمااا اتيااوني هو هنيااوني) ،المتتاااألالت الهتيونيااة تحمااي شااحنات
االتة وتالتالي تجذب إلي ا األحماض األمينية
والبروتينات ذات الشحنات الموجتة (اتيونات) والعا
حبيبة من مادة الراتنج حاملة
لمجموعات ذات شحنة سالبة
ي حالة المتتاألالت األنيونية تهون الحبيتات مرتتطة تشوارأل
الحبيبة
السوأليوا الموجتة بي ا اتعما
يات.ألا ي مذه الطريلة كألة مواأل من ا ماألة
الراتنج ( ) resinوالتي يناف إلي ا تعأل تحنيرما
متتاأل اتيوني م ي مجموكات الا ونيي SO3-
ااي مااذه الحالااة يااتا ونااع .اايط األحماااض األمينيااة كنااأل pHحامنااي ااي هك اا ،العم اوأل
المحتااو ك اا ،المتتاااألالت الهتيونيااة ،وكنااأل ماارور األحماااض األمينيااة .ا
العماوأل تنجااذب
إلاا ،حبيتااات ال اراتنج وت تسااق ب ااا ير ااع pHتااألريجيا وت.اار األحماااض األمينيااة ماان ها ا ي
العما اوأل حا ااب الترتي ااب التس اااكألر لل اايا ( pHiكن ااأل pH=pHiتس اات ش ااحنة الحم ااض
األميني معألومة ويتو التجاذب بينه وبين حبيتات الراتنج)
كناأل إااات.ألاا كماوأل المتتاااألالت األنيونيااة يااتا تغيياار pHماان اللاكااأل إلاا ،الحامنااي وتناات
األحماض األمينية حاب الترتيب التناتل ،لليا pHi
خليط من
األحماض
األمينية
عمود
26
استقبال المحلول
النازل من العمود
األمينية
تركيز األحماض
زمن الخروج
التبادل
الكتيوني
ي ااتا تح ي ااي محت ااور الج ااتف الن ااات بواا ااطة ااش ااي ل ااي وتل اار نت ااائج التح ي ااي ك اا ،ش اااي
منحنيات تتنااب مااحت ا مع امية الحمض األميني ي ال .يط
يماان التعارف ك ا ،ناوع الحماض األميناي حااب تمان ال.ارو (تمان المااك) ( retention
)timeهو حجا المح و الناات (الماتاح) (Ve) elution volumeالاذ يحاألأل مان .ا
العينات المع ومة
تركيز األحماض األمينية
زمن الخروج
بعض التفاعالت الكيميائية بين األحماض األمينية:
27
م ا ااا :1ههاا ااألة مجموكا ااة SHلحما ااض Cysلتها ااوين جاا اار نا ااائي الهبريا اات ل ح ا اااظ ك ا اا،
الترايا ااب البنا ااائي ل بروتينا ااات اما ااا ا ااي حالا ااة األناا ااولين ( 3جاا ااور نائيا ااة الهبريا اات) وان ا اتيا
الريبونيوا يات ( 4جاور نائية الهبريت)
م ا :2ت اك ت مجموكتي األمين والهربواايي :
وذلك لتهوين راتطة هميأل هو مايعرف ي الببتيألات والبروتينات تالراتطة الببتيألية
NH2-CHR-CO-NH-CHR1-COOH
NH2-CHR-COOH + NH2-CHR1-COOH
الببتيدات
تتحااأل األحماااض األمينيااة باارواتط ببتيأليااة لتهااوين الببتيااألات ويااام ،المراااب الناااتج :نااائي هو
ي هو رباك ،الببتيأل حاب كألأل األحمااض األمينياة الماوناة لاه ،وياام ،متعاألأل الببتياأل إذا
إحتور ك ،كألأل ابير من األحماض األمينية
لهاي ببتيااأل ن اياة همينيااة وه.ارر اربوااااي ية (، )N-TERMINAL , C-TERMINAL
ويتهون ا ااا الم ساي ل ببتياأل مان األااماف الم.تسارة لاحمااض األمينياة الألا .اة اي ترايتاه
حاب تا ا ا إبتألاف من الن اية األمينية
م ا Ser-Gly-Tyr-Ala-Leu :مو .مااي ببتيأل Pentapeptideويام ،االتالي:
Seryl-Glycyl-Tyrosyl-Alanyl-Leucineويعن ااي الملطا ااع ylهن الحما ااض األميناااي
مرتتط بوااطة مجموكتاه الهربواااي ية با ا NH2لحماض هميناي ماوالي تلاوا تعاض الببتياألات
تأألوا ار مامة ا رمونات هو مناألات حيوية
شحنة الببتيدات
تحتااو اااي الببتيااألات ك اا ،مجموكااة همااين ومجموكااة اربواااايي ن ائيتااان ومااي بااذلك نائيااة
التأين وت.ت ي الببتيألات يما بين ا اي تاأين الا ااي الجانبياة ،مماا يناتج كناه ا.ات ف اي
ال.وال الحمناية واللاكألياة والشاحنة وااذا ااركت ا اي المجاا اله رباائي ولهاي ببتياأل نلطاة
تع اااأل ا رب ااائي ته ااون كن ااألما محسا ا ة الش ااحنة معألوم ااة واليتج ااه كن ااألما الببتي ااأل إل اا ،ه م اان
28
اللطبين
البروتينات
مااي همااا المراتااات الحيويااة وتتهااون غالتااا ماان كااألأل ابياار ماان األحماااض األمينيااة مرتتطااة
باارواتط ببتيأليااة يع اوأل التنااوع الهبياار ااي البروتينااات إلاا ،ا حتماااالت الهبي ارة التااي تنااتج كاان
إ.اات ف تا اااي األحماااض األمينيااة م ا
تهااون إحتماااالت نااائي ببتيااأل يحتااو ك ااAla ،
ح اوالي 39إحتماااال ،وي اتألاأل كااألأل ا حتماااالت بتياااألة كااألأل األحماااض األمينيااة الماونااة إلاا،
هكألاأل المتنامية ي متعألألات الببتيألات والبروتينات
تقسيم البروتينات
تلاا البروتينات حاب الولي ة التي تلوا ب ا إل:،
-1ا نتيمات :ومي بروتينات ذات ولي ة .اسة تعمي ك ،ااير الت ااك ت الحيوياة ،ولهاي
ت اكي حيو إنتيا .ال
-2بروتينااات النلااي :م ااي بروتينااات الااألا والتااي تلااوا بنلااي هيونااات هو جتيئااات ماان كنااو إلاا،
.اار وهمم ااا ال يموج ااوبين الااذ ينلااي األهاااجين ماان ال ارئتين إلاا ،األناااجة الم.ت ااة تماااا
كم ية ههاألة المواأل الغذائية وتحرير الطا ة
-3البروتينات الغذائية وال.تنية :م ي هلبيومين البيض وااتيين الح يب ،تا نا ة إلا ،العألياأل
من البروتينات الم.تنة ي البذور النتاتية والنرورية لنمو الجنين
-4بروتيناات الحراااة :ومااي البروتينااات التااي تهاااب ال .يااا واألناااجة اب يااة الحراااة والااتل ل
وتغييا اار الشا اااي وما اان هما ااا هم ت ا ااا بروتينا ااات األهتا ااين والميا ااوتين ا ااي العن ا ا ت وبا ااروتين
Tubilineالموجوأل ي هاواي الحيوانات وحيألة ال .ية
-5البروتينات الترايبية (البنائية) :م ي ت ك البروتيناات الماوناة ل علااا ،الغنااريي ،الشاعر
،السااوف ،األنااا ر ،السا ائ
إلااخ وماان همااا هم ت ااا بااروتين الهاوالجين Collagen
الماون األاااي لاناجة الناامة و الهيراتيناات الماوناة ل شاعر وال باروين Fibroinالمااون
ل حرير
29
-6البروتينا ااات المناكيا ااة :م ا ااي الج وبيولينا ااات المناكيا ااة الم.ت ا ااة ، Immonoglobulines
ومااي بروتينااات مت.سسااة تساانع ااي .يااا الااألا البيناااف ويمان ااا التعاارف واللناااف ك اا،
التاتيريا وال يرواات والجتيئات الغريتة
-7البروتين ااات المنلم ااة :م ااي ال رمون ااات ااألنا ااولين واله ي اار م اان ال رمون ااات األ .اارر ذات
الطبيعة البروتينية
تلاا البروتينات اذلك حاب ترايب ا الهيميائي ووجوأل المجموكات غير البروتينية إل:،
-1بروتينات تايطة والتي تحتو ك ،هحماض همينية لط
-2بروتينااات مراتااة والتااي تحتااو ناامن ترايب ااا ك اا ،هجاتاف غياار بروتينيااة تااام ،المجموكااة
المرتتطة Prosthetic groupوتلاا البروتينات حاب نوع المجموكة المرتتطة إل:،
* بروتينا ا ااات اا ا ااارية (ج ياوبروتينا ا ااات :)Glycoproteinsوما ا ااي بروتينا ا ااات مرتتطا ا ااة ما ا ااع
ااريات م ي بروتينات األغشية
* بروتينااات ألمنيااة (ليبوبروتينااات )Lipoproteinsوتوجااأل ا ي ا ار ااي مسااي الااألا واألناااجة
العسبية
* بروتينات معألنية ( )metalloproteinsوتحتو ك ،هيونات معألنية م ي الحأليأل
* بروتين ااات م ون ااة ( )chromoproteinsوم ااي بروتين ااات مرتتط ااة تمجموك ااات م ون ااة م ااي
ال يموج وبين الذ يحتو ك ،مجموكة ال يا
* بروتينااات ا ا ورية ( )phosphoproteinesومااي بروتينااات مرتتطااة تمجموكااات ا ا ات
م ي الهاتيين الموجوأل ي الح يب وال يتي ين Vitellineالموجوأل ي س ار البيض
* بروتينات نووية ( )nucleoproteinesومي بروتيناات متحاألة ماع األحمااض النووياة م اي
ال اتونات
ومناااك تلااايا .اار يلاااا البروتينااات إل اا ،ااامين رئيااايين حاااب شااا ا ال.ااارجي وتعااض
ال.وال ال يتيائية إل: ،
-1البروتين ااات الهروي ااة (proteins
)Globularوم ااي بروتينا ااات تنط ااو بألرج ااة شا ااأليألة
30
وتتهااأل
لتعطااي شاااي ااارو
وتتمياات البروتينااات الهرويااة كاااألة تلاب يت ااا ل ااذوتان ااي الماااف
وولي ت ا الألينامياية اإنتيمات هو بروتينات نلي هو بروتينات مناكية
إلخ
-2البروتينااات ال ي يااة ( )Fibrous proteinsومااي بروتينااات لي يااة ذات ا اااي ماااتليمة
تتميات غالتاا تعاألا اب يتي اا ل اذوتان اي الماااف وولي ت اا البنائياة الترايبياة ،حيام يشااي هغ ب ااا
هجتاف مامة ي ترايب األناجة الم.ت ة
ألرااة البروتينات
استخالص وفصل البروتينات:
هو .طوة ي ألرااة البروتينات تتط ب إات .س ا من األناجة الحية هو الااوائي الجاامية
المحتوية ك ي اا إذا اانات البروتيناات ألا.اي ال .ياا ياتا إات .سا ا بواااطة محالياي منلماة
منااتة تعأل احق النايج تالة الحواجت م ي األغشية والجألران ال .وية
ي ااتا تع ااأل ذل ااك س ااي البروتين ااات ك اان المرات ااات غي اار البروتيني ااة وذل ااك بترا اايب البروتين ااات
بواا ااطة المحالي ااي المش ااتعة لاما ا ح المتعاألل ااة م ااي محالي ااي ابريت ااات المغنا اايوا MgSO4
هوابريتات األمونيوا (NH4)2SO4
تعأل تراب البروتينات بإات.ألاا الم ا المتعااأل ياتا إجاراف الطارأل المراات وا حت ااظ تال ارااب
ليعااأل إذابتاه اي المح او المانلا مان جأليااأل ماذا المح او يحتاو ك ا ،البروتيناات تا نااا ة
إل ،الم
المات.ألا ي كم ية الترايب يتا ي ال.طاوة الموالياة ساي البروتيناات كان الم ا
تعألة طرا من ا طريلة الميت ( )dialysisوتعتمأل مذه الطريلة ك ،وجوأل غشاف نساي ن اوذ
(تش اااي ا ااي
هو ح اااجت) يا اام تم اارور الجتيئ ااات الس ااغيرة م ااي األما ا ح وال يا اام تم اارور
الجتيئ ااات الهبيا ارة م ااي البروتين ااات ويما اان تاا اريع كم ي ااة المي اات تال ااألوارن ك اان طري ااق ج ااات
الألوران المغناطياي (الشاي)
تعااأل إنت اااف ا ااات .ل نحسااي ك اا ،مح ااو يحتااو ك اا ،اااي البروتينااات هو كااألة محاليااي
يحتو اي من ا ك ،اا من البروتينات و ي ا تا الحالتين يحتو المح و ك ا ،كاألأل ابيار
جاألا مان هناواع البروتيناات مماا يتط ااب سا ا كاان تعنا اوالتعرف ك ي اا لغاارض أل ارااة هحااأل
31
هنواك ا
كيس الميز :غشاء نصف نفوذ
يحتوي على محلول بروتيني
المحلول الخارجي
تسريع الميز بالدوران
طرق فصل البروتينات
يتا سي البروتينات بإات.ألاا كألة طرا ت.ت ي ي األاا
،وتعتمأل طرا سي البروتينات ك ،كألة ها
من ا:
الذ تعتمأل ك ياه كم ياة ال ساي
-1طارا ساي تعتماأل ك ا ،الشاحنة :ومان هم ت اا اروماتوغ ار ياا التتااأل األياوني والتاي تشااته
الطريل ااة الما اات.ألمة ااي س ااي األحم اااض األميني ااة م ااع تع ااض ا .اات ف ااي ن ااوع الم اااألة
الحام ة
-2طرا سي تعتمأل ك ،الوتن الجتيئي م ي الترشي ال
مي والطرأل المرات
-3طرا سي تعتمأل ك ،الشحنة والوتن الجتيئي معا م ي ال جرة اله ربائية
-4طرا تعتمأل ك ،ها
.اسة م ي اروماتوغ ار يا التجاذب والطرا المناكية
و يما ي ي وسي م.تسر لتعض الطرا المات.ألمة ي سي البروتينات:
الهجرة الكهربائية : electrophoresis
32
تاااير البروتينااات تاااركات م.ت ااة ااي مجااا ا ربااائي ممااا ي ا أل إلاا ،س ا ا تعتمااأل مااذه
الاركة ( )vك ،كألة كوامي من اا اوة المجاا اله رباائي ( )Eالشاحنة الساا ية ل باروتين ()z
تا ن ااا ة إل اا ،كام ااي ( )fيتع ااق تش اااي ووتن الب ااروتين تا ن ااا ة إل اا ،ن ااوع الم اااألة الحام ااة
(لتوجة الماألة ال
مية) إن وة احب البروتين إلا ،اللطاب الم.االي اي الشاحنة يعبار كن اا
با ( )Ezلهن الحراة تتأ ر تالعامي ( )fحيم تهون الاركة v=E(z)/f
ي ااتا ال س ااي ك اا ،م اااألة م مي ااة والت ااي تحت ااو ك اا ،ما ااامات وتعم ااي امن .ااي تعب اار .ل ااه
جتيئااات البااروتين تاااير جتيئااات البااروتين .ا
الماااألة ال
ميااة ت عااي المجااا اله ربااائي
حياام تنتلااي البروتينااات السااغيرة تاااركة ههباار نل ا ار لل ااة إحتهاه ااا تماااامات الماااألة ال
ميااة
بينما تاير البروتينات الهبيرة تاركة ه ي
يوجااأل حاليااا هنااواع ا ي ارة ماان الم اواأل ال
ميااة التااي تااات.ألا ااي سااي البروتينااات وماان هه رمااا
إاتعماال ماألة متعألأل األهري ميأل polyacrylamideوالتاي تمتاات تاون اا مااألة .ام اة يماان
التحاا ي ألرجة مااميت ا
ينااف كاااألة إلا ،ال .اايط البروتيناي ماااألة ، )Soduim Dodecyl Sulfate (SDSومااي
ماااألة هنيونيااة تهاااب البااروتين شااحنة اااالتة ابي ارة وتعمااي ك اا ،سااي الاارواتط النااعي ة مااذه
الشاحنة ت ااوا ا يا ار شااحنة الباروتين حياام ياتااب البااروتين تعاأل إرتتاطااه تمرااب SDSشااحنة
االتة لهي حمنين همينيين ي الا ا ة الببتيألية
لوغاريتم الوزن الجزائري
الهجرة نحو القطب السالب
محلول منظم
مسافة الهجرة
يونااع .اايط البروتينااات مااع ماااألة SDSااي ناحيااة اللطااب الا االب ألن ااا تتجااه ا ااا إلاا،
اللطااب الموجااب ااأل تهااون الماااألة ال
ميااة ااي سااورة هكمااألة ويااتا تنلاايط البااروتين مااع SDS
33
ي هك ،العموأل رب اللطب الاالب تاتجاه األا ي (اللطب الموجب) يتا تعأل انت ااف ال ساي
الهشي كن التلع تاات.ألاا ااشي منااب م ي هترا اومااي Comassie blue
تتنااااب حراااة البروتينااات كااااا مااع الااوتن الجتيئااي ويمااان راااا ك ااة .طيااة بااين لوغاااريتا
الوتن الجتيئي والماا ة التي يلطع ا البروتين ألا.ي المجا اله ربائي
تمتااات طريلااة ال ج ارة اله ربائيااة تاااات.ألاا ماااألة متعااألأل األهري ميااأل ااي وج اوأل SDSتالاااركة
والأل ة الهبيرة ي ال سي
توجأل حاليا تحويرات ا يارة ك ا ،ال جارة اله ربائياة ل بروتيناات حيام يماان إجاراف ال ساي ك ا،
هااا
نلطاة التعااأل اله رباي pHiوالتاي تهاون كناألما حرااة الباروتين معألوماة لعاألا وجاوأل
شحنة سا ية ك ،البروتين يمان اذلك إجراف ساي ا رباائي ك ا ،ما ا يحتاو ك ا ،تاألر
ااي pHو ااي غياااب ، SDSحياام يتحاارك البااروتين حتاا ،الوسااو إلاا ،المنطلااة ماان ال ا ا
التا ا ااي ياا ا ااون ي ا ا ااا pH=pHiتاا ا اام ،ما ا ااذه الطريلا ا ااة
focusing
isoelectric
)(electrofocalisation
يمان اذلك إجراف ال سي تال جرة اله ربائية ي اتجامين لتحاين كم ية ال ساي وذلاك بتغييار
هاا
ال سي ي االتجاه ال اني
الترشيح الهالمي :Gel-filtration
ويااتا ي ااا سااي البروتينااات حاااب وتن ااا الجتيئااي حياام يونااع .اايط ماان البروتينااات الذائتااة
ااي مح ااو ماانلا ااي هك اا ،كماوأل ال سااي المحتااو ك اا ،حبيتااات (اارات) مشااتعة تااالمح و
تساانع الحبيتااات ماان ماااألة الألااااتران (اااار متعااألأل) تعاارف تجاريااا تماااألة sephadexتوجااأل
هنواع ا يرن من ماألة sephadexت.ت ي ي ألرجة مااميت ا
تااأل.ي البروتينااات السااغيرة ألا.ااي الماااامات وتتااأ.ر ااي ال.اارو ماان ها ا ي العم اوأل بينمااا ال
تاااتطيع البروتينااات الهبيارة الااأل.و
ااي الماااامات وت.اار ماان العماوأل تاااركة ههباار يتنااااب
الااوتن الجتيئااي ل بااروتين كااااا مااع تماان ال .ارو هو مااا يعاارف بااتمن الماااك ( retention
)timeومو التمن ال تا ل.رو البروتين من ها ي العموأل يمان التعبير ك ،تمان ال.ارو
ااذلك تحجاا ا اتحاة ) Elution Volume (Veوماو الحجاا الا تا ل.ارو الباروتين مان
34
ها ي العموأل
جزيئة صغيرة
جزيئة كبيرة
حبيبات
مسامية
عمود الفصل
حجم اإل زاحة لجزيئة كبيرة
تركيز البروتين
حجم اإل زاحة لجزيئة صغيرة
الحجم المزاح
يمان راا منحن ،بين لوغاريتا الوتن الجتيئاي وحجاا ا اتحاة وتهاون الع اة .طياة تاات.ألا
م ااذه الع ااة ااي التع اارف ك اا ،الب ااروتين ام ااا تا اات.ألا ااي تحألي ااأل ال ااوتن الجتيئ ااي ل ب ااروتين
المج و
تااات.ألا طريل ااة الترشااي ال
الوتن الجتيئي ل بروتينات
م ااي ااي تنلي ااة البروتين ااات وا نتيمااات ام ااا تااات.ألا ااي تحأليااأل
تسلسل األحماض األمينية في البروتينات
تحتااو ال .يااا الحيااة ك اا ،الف األن اواع ماان البروتينااات لهااي من ااا تا اااي .ااال وولي ااة
ممي اتة إن لتا اااي األحماااض األمينيااة ألور ابياار ااي تحأليااأل شاااي وولي ااة البااروتين وذلااك
35
لعألة هاتاب همم ا :
-البروتينات ذات األألوار الم.ت ة ل ا تا اي م.ت ي من األحماض األمينية
العأليأل من األمراض الو ار ية الماتش ة يعوأل ابب ا إلا . ،اي اي تا ااي األحمااض األمينياةي بروتين معين ،م ي مرض األنيمياا المنج ياة Sickle-cell anemiaاماا هن
ام ماذه
األماراض الو ار يااة تلريتااا يعاوأل ااابب ا إلاا ،تغياار ااي تا اااي حمااض همينااي واحااأل (امااا ااايأتي
ذاره)
كنا ااأل ملارنا ااة بروتينا ااات ذات هألوار م.ت ا ااة ي حا ااأ إحتوافما ااا ك ا اا ،تا اا ااي م.ت ا ااي ما ااناألحم اااض األميني ااة ام ااا هن البروتين ااات المتش اااب ة ااي الولي ااة تتش اااته ا يا ا ار ااي تا ا ااي
هحمان ا األمينية ي هجنا
نتاتية وحيوانية تعيألة كن تعن ا من الناحية التسني ية
مي يتشاته تا اي األحماض األمينية ا يا ي البروتينات ذات الولائي المتشاب ة ؟
الج اواب :مناااك تشاااته غياار ا ااي ،ه هن مناااك ناااتة ماان ا .اات ف ااأل تسااي ااي حالااة
ا ناااان م ا
ماان 20إلاا 30% ،ماان شاا.ل .اار ،مااذه ا .ت ااات ال ت ا ر ا ي ا ار ك اا،
الولي ااة يما اان الل ااو هن تا ا ااي األحم اااض األميني ااة ااي ب ااروتين مع ااين ذات إرتت اااي و ي ااق
بولي ااة البااروتين ،حياام ي حااأ هن األحماااض األاااااية ااي ولي ااة البااروتين ال تتغياار بينمااا
يتغير تا اي األحماض األمينية ي مناطق ه.رر ألون هن ي ر ك ،الولي ة
و بااي هن ن.ااوض هه اار ااي همميااة تا اااي األحماااض األمينيااة ااي البروتينااات نلااي كنااأل اي يااة
تحأليأل مذا التا اي من الناحية العم ية
تحديد تسلسل األحماض األمينية في البروتينات
ت ااا تحألي ااأل تا ا ااي األحم اااض األميني ااة ااي ب ااروتين األنا ااولين ألو ما ارة م اان ط اارف الع ااالا
Frederick Sangerااي اانة 1953واااان ذلاك ماان هماا االهتشااا ات اي تاااريخ البيولوجيااا
وتط ب هنذاك مج وألات ابيرة وو ت طويي نا ك ،إ رما العالا Sangerجائتة نوبي
يتهاون األنااولين التلار
bovine insulineالاذ ااات.ألمه ااانجر مان 51حماض هميناي
ويب غ وتنه الجتيئي 5700تلريتا يتهاون ماذا األنااولين مان ا اا تين ببتياأليتين ،الا اا ة A
36
تحتو 21حماض هميناي والا اا ة Bتحتاو 30حماض هميناي تارتتط الا اا تان بجاارين
نائيي الهبريت اما تحتو الا ا ة Aك ،جار نائي الهبريت ألا .ي
السلسلة A
طريااق تح يااي الجاااور نائيااة الهبرياات نتااا ج اتيئتين
ان B
السلسلة
و ااأل اااا اااانجر ت سااي الا اا تين كا
من الااتايين Cysteineإبتألافا من جتيئة واحألة من الااتين Cystine
37
وتعااأل تطااوير الطاارا التح ي ااة تااا تحأليااأل تا اااي األالف ماان البروتينااات تا كتماااأل ك اا ،ن ا
األا
التي إهتش ا العالا اانجر مع تطويرما وجع ا لية لإلاراع من العم ية وتياألة أل ت ا
توجااأل حاليااا طاارا حألي ااة تعتمااأل ك اا ،ها ا
م.ت ااة ااي تحأليااأل تا اااي األحماااض األمينيااة
و.اسااة تعااأل إهتشاااف طاارا ااريعة جااألا لتحأليااأل تا اااي ADNومعر ااة اااي الشا رات الو ار يااة
لاحماض األمينية ،تا نا ة إل ،طرا كات وتنلياة المور اات إذا تاا التعارف ك اي المور اة
ال.اسة ببروتين معاين اإن تحألياأل تا اا ا واااتنتا تا ااي األحمااض األمينياة يااون هاا ي
وها اارع له اان ا اي غي اااب مع وم ااات ك اان المور ااة يا ااون تحألي ااأل تا ا ااي الا اا ا ة الببتيألي ااة م ااو
الابيي الوحيأل وك ،وجه العموا إن الطريلتان متهام تان من الماألة الو ار ية إل ،الباروتين هو
من البروتين إل ،الماألة الو ار ية
بماذا يفيد معرفة تسلسل األحماض األمينية؟
إن معر ة تا اي األحماض األمينية ل بروتين يااكأل ا ي ار ك ا ،أل ارااة و اا التراياب ال ارغاي
ل بروتين ومنه الولي ة و لياة العماي ،اماا يعطاي مع وماات ه.ارر حاو مااان تواجاأل الباروتين
وتطور الهائنات الحية
إن ت اتي ااأل ك ااألأل التا اا ا ت المعرو ااة م ااع م اارور ال ااتمن هألر إل اا ،ت ااو ر مع وم ااات هه اار ح ااو
الع ااة بااين التا اااي ماان ج ااة واااي ماان الترايااب ال ارغااي والولي ااة ماان ج ااة ه.اارر مااذه
المع ومااات مونااوكة حاليااا ااي بنااوك ل مع ومااات تعااالج تااالهومبيوتر ل تحاام كاان اللواكااأل التااي
تحاا كم ية إنطواف الا اي الببتيألية وتهوين الترايب ال راغي ل بروتين
يااتا حاليااا اااذلك تساانيي البروتينااات المتلاربااة ماان حياام التا اااي البنيااة ااي كوائااي امااا هن
تعااض األحماااض األمينيااة ااي الا ا ا ة الببتيأليااة تعمااي اإشااارات تحااألأل مونااع البااروتين ااي
ال .ية واذا توجيه البروتين إل ،ماانه السحي ألا.ي هو .ار ال .ية
إن اا ااتنتا المع وم ااات ال.اس ااة تالبني ااة والولي ااة م اان .ا ا
معر ااة التا ا ااي هس اات م ااأل ا
ممان التحلياق نلا ار ل عاألأل الهبيار مان التا اا ت الماتشا ة ااي ياوا اي م.ت اي هنحااف العاالا
والاااركة الهبيارة ااي ت اتيااأل المع ومااات ال.اسااة بااذلك تاااات.ألاا هج اتة الحااااوب المتطااورة ذات
38
الاعة والاركة الهبيرتين
بنية البروتينات
امااا هن لهااي بااروتين تا اااي .ااال ماان األحماااض األمينيااة ،ااإن لهااي بااروتين اااذلك شاااي
راغي وبنية .اسة ومميتة ومان هماا الطارا التاي اااتعم ت وال تا ات تااتعمي اي أل ارااة بنياة
البروتيناات ماي طريلاة حياوأل األشاعة الااينية و األ تاا .ا
هجريت ك ،البروتينات ااتنتا العأليأل من األا
-1البنية ال راغية
الأل ارااات المتعا تاة والما اة التاي
همم ا:
ية األتعاأل ل بروتين يحألألما تا اي األحماض األمينية
-2ولي ة البروتين تحألألما البنية ال راغية ل بروتين
-3لهي نوع من هنواع البروتينات بنية .اسة ال توجأل ي هنواع ه.رر من البروتينات
-4هغ ب الرواتط التي تحا أ ك ،مذه البنية ال راغية مي رواتط نعي ة وغير تااممية
لوسي بنية البروتينات ا ترح ك ماف الهيمياف الحيوية هرباع مااتويات تتاألر اي التعلياأل وماي:
البنية األولية وال انوية وال ال ية والراتعية
البنية األولية:
-1البنيةةةة األوليةةةة ( :)primary structureمااي ارتتاااي كااألأل ماان األحماااض األمينيااة
باارواتط ببتيأليااة وم اي كتااارة كاان تا اااي األحماااض األمينيااة تتمياات البنيااة األوليااة بوج اوأل نااوع
واحأل من الرواتط بين األحماض األمينية وكألا وجوأل ه انطواف ل ا ا ة الببتيألية
-2البنيةة الاانويةة ( :)secondary structureماي الت ااف الا اا ة الببتيألياة ذات البنياة
األولية ي مناطق محألوألة ي شاي بنية ح تونية هو هوراا مطوياة هو منااطق انعطااف
تتميت مذه البنية بوجوأل الرواتط ال يألروجينية بين مجموكاات C=Oومجموكاات N-Hالتاتعاة
ل رواتط الببتيألية
-3البنيةةة الاالايةةة ( :)tertiary structureومااو الشاااي ال ارغااي
ااي األتعاااأل الااذ
تأ.ااذه الا اا ة الببتيأليااة ذات البنيااة ال انوياة تأ.ااذ البروتينااات مااذه البنيااة تعااأل انطوافمااا تشاااي
39
ت لائي يحألأله العأليأل من العوامي الألا .ية وال.ارجية
-4البنية الرابعية ( :)Quaternary structureيوجأل اي تعاض البروتيناات التاي تتهاون
من هه ر من ا اا ة ببتيألياة واحاألة ويعبار كان التوناع ال ارغاي ل ا ااي الببتيألياة يماا بين اا
والتااي ياااون لهااي من ااا بنيااة ال يااة ،وتااام ،اااي ا ا ا ة ناامن البنيااة الراتعيااة بتحاات الوحااألة
()subunit
ل ااا بني ااة البروتين ااات هه اار يجااب معر ااة .س ااائل الراتط ااة الببتيأليااة وا ااذا ال اارواتط وال ااذرات
المجاورة ل ا
الرابطة الببتيدية
إن الأل اراااات التااي اااا ب ااا العالمااان Linus Paulingو Robert Coreyك اا ،الاارواتط
الموجوألة ي الا ا ة الببتيألية و.اسة الراتطة الببتيألية بإات.ألاا األشاعة الااينية ه مارت إلا،
إهتشاف العأليأل من ال.سائل الترايبية ال امة التي ارت اله يار مان التراهياب ال انوياة التاي
تأ.ذما الا ا ة الببتيألية
ماان المعااروف هن بااين اااي ذرتااي اربااون(C)
تااااممية مااي N-C
ااي مياااي الا اا ة الببتيأليااة ا م رواتااط
C-N , C-Cوماان همااا الممياتات التااي ههتشا ا العالمااان نااذار
ماي ي:
-1الراتطة الببتيألية والذرات المتس ة ب ا متاشرة ومي Oو Hتهون ي ماتور واحاأل ،اماا
هن ال ااألوران ك اا ،مح ااور الراتط ااة الببتيألي ااة C-Nغي اار مما اان وذل ااك ارج ااع إل اا ،هن الراتطاااة
المتألوجة غير ابتة ومي متحراة بين C=Oو C=N
-2يتون ااع Oالت اااتع لمجموك ااة C=Oو Hالتاتع ااة لمجموك ااة N-Hااي ون ااع م ااروا
transألائما
-3مناك إماانية ل األوران حاو محاور الاراتطتين N-Cو C-Cيساط
ك ا ،تاامية
تاوية الألوران حو الراتطة N-Cتالرمت ) (وحو الراتطة C-Cتاالرمت) )وتهاون
مذه التوايا مااوية ل س ر كنألما تهون اي الرواتط ي ماتور واحأل
من الناحياة النلرياة األ تأ.اذ الاتاويتين و ه
40
يماة باين 180-و 180ألرجاة ،لهان
الألوران محألأل بتألا.ي الذرات والمجموكات المتجاورة واذا بنوع الا اي الجانبية
الوحدة الببتيدية
(مستوى واحد)
الكربون
الوحدة الببتيدية (مستوى واحد)
يمااان اكتتااار الا ا ا ة الببتيأليااة ماااتويات ماان الوحااألات الببتيأليااة ت س ا ا مجموكااات CHR
مما يحأل ا ي ار من األشاا ال راغياة التاي يماان ل ا اا ة الببتيألياة هن تأ.اذما اي ال ا ار وذلاك
حاب يمة التوايا و
البنية الاانوية للبروتينات
إن الأل ارااات التااي اااا ب ااا العالمااان Paulingو Coreyااامحت تااا تراح البنيااات ال انويااة
و ل بروتينات ي انة 1951
41
ه -البنيااة الح توني اة : (-Helix ) وجااأل العالمااان هن ها ا ي األشاااا الااذ يمااان هن
تأ.ااذما الا ا ا ة الببتيأليااة م اي الشاااي الح تونااي ل ياااي الا ا ا ة C-C-N-Cمااع إمتااألاأل
الا اي الجانبية .ار إطار الترايب الح توني
ك اا ،غ ارار التراهيااب الح تونيااة كمومااا يمتااات مااذا الترايااب بوحااألة متهااررة تمتااأل ك اا ،ماااا ة
0.56ن ااانومتر ك اا ،ط ااو مح ااور التراي ااب الح تون ااي ،تم ااي الوح ااألة المته ااررة ألوران اام ااي
ملألاره 360ألرجة
يمتات الترايب الح توني بتواية تتراوح من 45-إل 50- ،ألرجة و = -60
طرق مختلفة لتمايل البنية الاانوية الحلزونية
ألرجة وتحتو اي ألورة (وحألة متهررة) ك 3.6 ،حمض هميني وياون ا لت اف يميني
يحا ااا أ الترايا ااب الح تونا ااي ك ا اا ،تاتا ااه بوج ا اوأل كا ااألأل ابيا اار ما اان الا اارواتط ال يألروجينيا ااة با ااين
مجموكات C=Oو N-Hحاب اللاكألة n+4ي ن
الترايب الح توني إن الشاي
ابط Hعمودية على
الرو
42
محور التركيب الحلزوني
السالسل الجانبية (الجذور)
متجهة نحو الخارج
هيكل السلسلة
الببتيدية
الح توني يعأل الترايب الم الي الذ يام بتهوين ههبار كاألأل مماان مان الارواتط ال يألروجينياة
مما يعطي ل ذا الترايب ا اتلرار وال تات
ي ا ر ك اا ،الترايااب الح تونااي تواجااأل تعااض األن اواع ماان األحماااض األمينيااة م ااي الباارولين
Proالذ ال يتواجأل كاألة ألا.ي الترايب الح توني ،اما هن تواجأل تعض األحمااض األمينياة
ي تا ا ت معينة يعيق إاتلرار الترايب الح توني
ب -البني ااة ال انوي ااة : -Structure تا ن ااا ة إل اا ،التراي ااب الح تون ااي إهتش ااي
العالمان Paulingو Coreyبنياة .ارر ااميت البنياة و ي اا تمتاأل الا اا ة الببتيألياة إلا،
43
ه ساما ي سورة متعرجة Zigzagوال تنطو
ي شاي ح توني
ااي بااروتين ال بااروين fibroineالماااون ل حرياار تسااطي الا اااي هماااا تعن ا ا ماونااة
ترايب يعرف تاألوراا المطوية ()pleated sheet
ترتتط المناطق ذات البنية ال انوية بوااطة العأليأل مان الارواتط ال يألروجينياة باين مجموكاات
C=Oو N-Hو ا ا ااأل ته ا ا ااون المن ا ا اااطق متواتي ا ا ااة parallelesهو متعاها ا ا ااة
anti
parallelesي حالة بروتين الحرير تهون المناطق متعاهاة وغنية تحمناي Alaو Gly
ي سورة متناوتة
تحتااو البنيااة ال انوياة ل بااروتين ك اا ،نلاااي ا نعطاااف ( نلاااي تغيياار ا تجاااه ) turns
و ي ااا تغياار الا ا ا ة الببتيأليااة ماان إتجام ااا بااألوران ملااألاره 180ألرجااة ويتمتااأل مااذا ا نعطاااف
لما ااا ة 4هحم اااض هميني ااة تح ااا أ م ااذه النل اااي ك اا ،تات ااا لوجا اوأل روات ااط ميألروجيني ااة ب ااين
مجموكة N-Hل حمض األو مع مجموكة C=Oل حمض الراتع ()n+3
اما ي حأ تواجأل البرولين ي مذه المناطق نل ار لترايته وشا ه ال.ال واحتوافه ك ،
44
(نلاي تغيير ا تجاه ) turns
مجموك ااة imineب ااأل مجموك ااة amineالموجا اوألة ااي ت ااا ي األحم اااض األميني ااة الراتط ااة
الببتيأليااة الماونااة ماان الباارولين تأ .اذ الونااع المتلابااي Cisبااأل الونااع الم ااروا transااي
األحماض األمينية األ.رر
متوازية
متعاكسة
للبروتين:
تمايل البنية الفراغية
45
كنااأل أل اراااة هو تااألري
البنيااة ال راغيااة ل بااروتين نحتااا إلاا ،تم يااي م اذه البنيااة تااااتعما كااألة
نماااذ م ااي نمااوذ اله ارة والع اوأل Ball & Stickو النمااوذ الماااأل
Spacefillوالع اوأل
Stickوغيرم ااا م اان النم اااذ الت ااي تا ااتعمي لتم ي ااي الجتيئ ااات كن ااأل الهيمي ااائيين ا ااذلك له اان
تونااي بنيااة البااروتين يتط ااب ااااتعما نماااذ ه.اارر لتونااي ماااتويات البنيااة ال راغيااة م ااي
البنيات ال انوية وال ال ياة والراتعياة ومان باين النمااذ المااتعم ة ا يا ار ماي النماوذ الشاريطي
Ribbonsو يه تل ر البنياة الح تونياة تشااي ح توناي وانا بينماا تل ار البنياة ال انوياة
تشاااي ماااط ذات ها ا ا لتونااي اتجاااه الا ا ا ة الببتيأليااة وتميياات المتواتيااة والمتعاهاااة
اما يمان ااتعما الشاي االاطواني لتوني البنية الح تونية
البنيةاالاانوية
شريط
أسطوانة
مناطق اإلنعطاف
مي مناطق ال تأ.ذ البنية وال البنية ويمان هن نجأل من ا نوكان:
مناطق انعطاف طوي ة وذات هشاا غير محألألة وتتواجأل بين البنيات هو بين و
منطلااة إنعطاااف وتتواجااأل بااين بنيتااين ااانويتين ماان نااوع المتعاهاااة وتأ.ااذ شااا محااألألا
طول ااا ال يتع ااألر 5هحم اااض هميني ااة (غالت ااا هربع ااة) وتحت ااو ك اا ،راتط ااة ميألروجيني ااة ب ااين
مجموكة COو NHحاب اللاكألة n+3
46
(نلاي تغيير ا تجاه ) turns
البنية الاالاية للبروتين
مااي الت اااف لعااألأل ماان البنيااات ال انويااة لا ا ا ة ببتيأليااة واحااألة ت س ا ا مناااطق انعطاااف و ااأل
تهون البنيات ال انوية ا ا هو ا ا هو .يط من و راومات ت.طيطية
تحا أ البنية ال ال ية ك ،ااتلرارما بوااطة 4هناواع مان الارواتط :ابريتياة ،شاارألية ،اارماة
ل ماف وميألروجينية بين المجموكات الهيميائية الموجوألة ي الا اي الجانبية (الجذور)
كنااأل انطا اواف الا ا ا ة الببتيألي ااة ذات التراي ااب ال ااانور هو هو ا مم ااا بناااب م.ت ااة ااي
ال ا ار يأ.اذ الباروتين شااي
اي األتعااأل هو اارو
يساعب تحألياأل ال.اط ال اساي باين م اوا
البنية ال انوية وال ال ية اي حالاة البروتيناات ال ي ياة ،لهناه يماان اللاو هن ماذا المااتور مان
الترايااب يعباار ك اا ،التااوتع ال ارغااي لهااي الااذرات ااي البااروتين بينمااا تعباار البنيااة ال انويااة ك اا،
الع ة الترايبية الموجوألة بين األحماض األمينية المتجاورة ( ي مجا محألوأل)
تحا أ البنية ال ال ية ل بروتين ك ،تات ا لوجوأل كألأل من الرواتط همم ا :
-1الجاور نائية الهبريت الناتجة من جتيئتين من حمض الااتايين Cysteine
-2ال اارواتط الم حي ااة هو الش ااارألية (اله ربائي ااة الا اااهنة) electrostaticالناتج ااة م اان تجاااذب
الشا ا ااحنات المتعاهاا ا ااة الموج ا ا اوألة ك ا ا اا ،الا اا ا ااي الجانبيا ا ااة لاحما ا اااض األمينيا ا ااة اللاكأليا ا ااة
والحامنية
-3الرواتط ال يألروجينية الناتجة من تعض المجموكات ي الا اي الجانبية
-4تجاااذب األط اراف هو الا اااي الهارمااة ل ماااف م ااي الا اااي الجانبيااة لا ا Ile ، Pheو
47
Leu
تاات ناف الجاور نائية الهبريت اإن الارواتط المحا لاة ك ا ،التراياب البناائي ال الام ل باروتين
تهون نعي ة
تداخل الجذور
الكارهة للماء
متعاكسة
راتطة شارألية
رابطة
منطلة انعطاف
تداخل الجذور
هيدروجينية
الكارهة للماء
منطقة حلزونية
بنية االاية تحتوي على خليط من البنيات الاانوية و
إن االحتم ا اااالت العألي ا ااألة لتواج ا ااأل وتت ا اااتع البني ا ااات ال انوي ا ااة و ومن ا اااطق االنعط ا اااف هألر
تالم.تسين إل ،ا تاراح مااتويات ه.ارر مان البنياة ال راغياة ل بروتيناات تلاع باين البنياة ال انوياة
وال ال يااة وتعاارف تااالنموذ Motifو المجااا Domianوتسااي مااذه الماااتويات األشاااا
الم.ت ااة الناتجااة ماان تتاااتع البنيااات ال انويااة والتااي وجااألت متهااررة ااي العأليااأل ماان البروتينااات
و أل تهون النماذ والمجاالت متشااب ة ك ا ،طاو الا اا ة الببتيألياة ،اماا األ تحتاو الا اا ة
الببتيألي ااة الواح ااألة ك اا ،مج ااا هو ك ااألة مج اااالت متش اااب ة هوم.ت ااة و ااأل ا اام إح ااألام م ااذه
الماتويات إل ،تسانيي البروتيناات اي كوائاي ومجموكاات تحتاو ك ا ،ن ا
48
األناواع النمااذ
والمجاالت وتتشاته جتئيا اي الولي اة م اي البروتيناات النا اة كبار الغشااف والبروتيناات النا اة
ا لهترونات وغيرما
البنية الرابعية
مااو تجمااع ا اااتين ببتيااأليتين هو هه اار لهااي من ااا بنيااة ال يااة تااام ،اااي ا ا ا ة ببتيأليااة ألا.ااي
البنية الراتعية تااا تحت الوحألة sous unité
تحا ااا أ البنيا ااة الراتعيا ااة ك ا اا ،ااا ااتلرارما بوااا ااطة رواتا ااط غيا اار تاا اااممية اارما ااة ل ما اااف هاااا ااا
تا نا ة إلا ،رواتاط شاارألية وربماا ميألروجينياة ااذلك ال وجاوأل ل ارواتط التاااممية باين تحات
الوحألات
ااأل تهااون البنيااة الراتعيااة متجاناااة إذا ااناات الا اااي الببتيأليااة (تحاات الوحااألات) متشاااب ة هو
تهااون غياار متجاناااة إذا ااناات تحاات الوحااألات غياار متشاااب ة حتاا ،ولااو اااان تعن ا ا متشاااته
اما ي حالة ال يموج وبين 22هو إنتيا ab233c12 ATP synthase
ويمااان ماان .ا
الراااا الت.طيطااي الم اوالي تونااي اي يااة االنتلااا ماان البنيااة األوليااة إلاا،
ال انوية إل ،ال ال ية مرو ار تالنماذ والمجاالت :
بنية االاية
مجال
نموذج
م حلة :مناك ارة غير سحيحة كنأل كألأل ابير من الط تاة كان هن البنياة الراتعياة يجاب هن
تحتااو ك اا ،هربااع تحاات وحااألات ويعتباارون هن ااا اكااألة البنيااة الراتعيااة ال تعنااي هربااع تح اات
وحألات وانما البنية ال راغية األه ر تعليألا من البنية ال ال ية وتنا تحت وحاألتين هو هه ار و األ
تسي إل ،كألأل ابير من تحت الوحألات
استعمال الكمبيوتر لتمايل البنية الفراغية للبروتين
49
انتشاار ااي الااانوات األ.ي ارة ااااتعما ب ارامج امبيااوتر مت.سسااة ااي كاارض وتونااي البنيااة
ال راغياة
ياة األتعااأل ل بروتيناات ،و األ اااممت ماذه البارامج ا يا ار اي توناي البنياة ال راغياة
لااألر المااتع ا .اسااة كنااأل ااااتعمال ا احساال تطبيليااة ااي شاااي ورشااات تع يميااة و ااأل ااااما
تااو ر العأليااأل ماان مااذه الب ارامج م ااي Rasmolو Rastopو SwissPDB viewerتشاااي
مجاني ك ،شتاة ا نترنت ي انتشار ااتعما مذه البرامج من طرف األااتذة والط تاة اماا
اا اااما تا ااو ر الم ا ااات ال.اسا ااة تاا ااي البروتينا ااات المألرواا ااة ك ا اا ،شا ااتاة ا نترنا اات ا ااي بنا ااك
مع ومااات البروتينااات ) Protein Data Bank (PDBااي تماااين الألاراااين ااي م.ت ااي
هنحاااف العااالا ماان الحسااو ك اا ،ه ماان البروتينااات المألرواااة وااااتعمال ا ااي التااألري
و ااي
التحم
اما ااما ااتعما ماذه البارامج اي اا ولة الحساو ك ا ،ساور وهشااا تونايحية تااتعمي
نجات الهتب والمطبوكات الموج ة ل ط تة
قواعد هامة في انطواء البروتين
ماان بااين اللواكااأل ال امااة ااي انط اواف البااروتين المحااب ل ماااف م ااي ال يموج ااوبين والميوج ااوبين
وهلبيااومين الباايض وانا اتيا ال يااتوتيا م ااو تواجااأل األحماااض األميني ااة المحتااة ل م اااف ك اا ،اااط
البروتين وتواجأل األحماض األمينية الهارمة ل ماف ي ألا.ي ( ب) الجت ف
اللاكألة :هحماض همينية محتة ل ماف ك ،الاط
هحماض همينية اارمة ل ماف ي الألا.ي
ه .ي ي مذه اللاكألة أل ت أل إل . ،ي ي كمي البروتين ومرض و ار ي
ماال عن أشهر األمراض الورااة :األنيميا المنجلية ()Sickle-cell anemia
األنيمي ااا كموم ااا م ااي نل اال ااي اا ارات ال ااألا الحما اراف (نل اال ال يموج ااوبين) له اان الا اابب ااي
النلل ي.ت ي من حالة أل.رر يعاني المريض ي ماذه الحالاة مان ناعي كااا وكاألا اللاألرة
50
ك اا ،هألاف المج ااو العنا ي ،وكنااأل حاال كينااة ماان الااألا تحاات المج اار ي حااأ نلاال ااي
اارات الااألا الحم اراف تا نااا ة إلاا ،تغياار ااي شااا ا تأ.ااذ ا ارات الااألا الحم اراف الطبيعيااة شاااي
اللرل ملعر الوج ين بينماا تأ.اذ اي ماذه الحالاة الشااي المنج اي (م لاي) مماا يجع اا مشاة
و اب ة ل تهار تا ولة وت لأل باذلك محتواماا مان ال يموج اوبين اماا هن ماذه الهارات ال تااتطيع
الماارور كباار الشااعيرات الألمويااة السااغيرة ممااا يا أل إلاا ،إناااألاألما وتو ااي إمااألاأل النااايج تالااألا
(ومذا مو الابب الرئياي لموت المسابين ب ذا المرض)
الابب األس ي ل مرض و ار ي ي أل إل ،إنتا نوع من ال يموج اوبين ياام . HbS ،اا ل ا
HbAالطبيع ااي ااي ا نا ااان الع اااأل الت ااالغ كن ااأل ن ااتع األها ااجين م اان ال يموج ااوبين HbS
يساات غياار ابااي ل ااذوتان ويتجمااع ااي شاااي هلياااف طوي ااة ت ا أل إلاا ،تغياار شاااي ا ارات الااألا
الحمراف
هول ،الألرااات ه بتت هن النوع Sيتجه تاركة ه ي إل ،اللطب الموجب من الناوع Aمماا ياأل
ك اا ،هن النااوع Sيحتااو ك اا ،كااألأل ه ااي ماان األحماااض األمينيااة الحامنااية (ذات الشااحنات
الاااالتة) بإااات.ألاا ال ج ارة اله ربائيااة وتحأليااأل ماونااات وتا اااي األحماااض األمينيااة لهااي ماان
51
النا ااوكين ما اان ال يموج ا ااوبين وجا ااأل هن النا ااوع Sيحتا ااو ك ا اا Val ،با ااأل Gluا ااي النا ااوع A
الطبيعي وذلك ي الا اي bي الوناع ر اا 6مماا يعطاي ل ناوع Aشاحنتين ااالبتين هه ار
م اان الن ااوع Sم ااذا التغي اار التا اايط ااي التا ا ااي ل ااه ه اار ابي اار ك اا ،التراي ااب البن ااائي ال ارت ااع
ل بروتين
السلسلة العادية HbA
يتغير إلى
السلسلة المنجلية HbS
إن إاتبألا حمض هميني محب ل ماف( )Gluك ،الااط ال.اارجي ل باروتين تحماض هميناي
ااره ل ماف ( )Valيا أل إلا ،تهاوين نلااي اارماة ل مااف ك ا ،الااط ال.اارجي مماا يا أل إلا،
تجاااذب جتيئااات ال يموج ااوبين HbSال.اليااة ماان األهاااجين يمااا بين ااا وتجمع ااا ااي شاااي
هلياف
كنااأل أل اراااة الماااألة الو ار يااة لاشاا.ال المسااابين ب ااذا الماارض لااوحأ وج اوأل ط ارة و ار يااة ااي
مور ااة -Globineالحام ااة ل شا ا رة الو ار ي ااة ال.اس ااة تالا اا ا ة ل يموج ااوبين تن ااتج م ااذه
الط رة من تغير اكألة واحألة ي الش رة ال
ية لحمض Gluنتا
Val
جتيئات HbSحرة
52
بألاية تجمع جتيئات HbS
تشاي هلياف من HbS
نل ا ار ألن بنيااة البروتينااات ال ي يااة تعتباار تااايطة ملارنااة تالبروتينااات الهرويااة ااإن همميااة البنيااة
ال ال ية والراتعية تل ر ج يا ي البروتيناات الهروياة ذات األألوار اله يارة والمتنوكاة (إنتيماات ،
مرمونااات ،بروتينااات نلااي ،بروتينااات مناكيااة
إلااخ) لااذلك اااوف ي.ساال الجااتف المتتلااي
من مذا التاب لألرااة هم ة كن اي من النوكين من البروتينات (الهروية وال ي ياة) وماذا بارات
اال.ت ف الموجوأل بين ما من الناحيتين البنيوية والولي ية
البروتينات الكروية (المنطوية) ()Globular proteins
تأ.ااذ مااذه البروتينااات شااا ماألا اا نل ا ار النطوائ ااا الشااأليأل ممااا يعطااي ل بااروتين شاااي ااارو
ي األتعاأل
مامو الألليي ك ،وجوأل ا نطواف ي البروتينات الهروية ؟
-1كناأل ملارناة طااو الا اا ة الببتيأليااة المحااوب نلرياا تعااأل معر اة كااألأل األحمااض األمينيااة
وتا ا ا مع األتعاأل الحليلية ل باروتين الطبيعاي ي حاأ إ.ات ف ابيار ما
تحتاو الا اا ة
الببتيألية لبروتين هلبيومين مسي الألا ك 584 ،حماض هميناي ،إذا اانات ماذه الا اا ة ك ا،
شاي ترايب إن طول ا ياون 200نانومتر واما ا 0.5نانومتر إذا اانت الا ا ة ك ا،
شاي البنية الح تونية إن طول ا اياون 90نانومتر واما ا 1.1نانومتر لهن اللياااات
53
الحليلي ااة ألتع اااأل لب ااروتين هلبي ااومين مس ااي ال ااألا الطبيع ااي هل اارت هن ههب اار تع ااأل ل ااه م ااو 13
ناانومتر لااط واااماه حاوالي 3ناانومتر إن مااذا ال اارا الهبياار اي األتعاااأل ال يمااان ت ااايره إال
تعم ية ا نطواف الشأليأل
االحررة العالي ااة هو pHالع ااالي هو الم اان .ض ج ااألا ي ل ااأل .واس ااه
-2كن ااأل معام ااة الب ااروتين ت ا ا
الطبيعي ااة هو ي .اارب ( )denaturationوي ل ااأل الب ااروتين نش اااطه البيول ااوجي إن م ااذه العوام ااي
تغياار ماان االنط اواف ألن ااا ت ا ر ك اا ،الاارواتط النااعي ة التاا ،تعمااي ك اا ،تااات البنيااة ال راغي اة
ل بروتين
بروتين الميوجلوبين )Myoglobin (Mb
مو هو باروتين تاا تحألياأل بنيتاه ال راغياة مان طارف العاالا John Kendrewوماااكألوه اي
انوات ال.ماينات تاات.ألاا طريلة حيوأل األشعة الاينية
الميوج وبين مو باروتين م اون يوجاأل اي العنا ت لهناه يا ار اي كنا ت تعاض الحيواناات
التحرية م ي الحوت ويعمي ام.تن لاهاجين الاتعماله كنأل الحاجة
ااتعمي العالا Kendrewي ألرااته بروتين الميوج وبين من الحوت ألنه مساألر غناي جاألا
ب ذا البروتين
يتهااون مااذاالنوع ماان الميوج ااوبين ماان ا ا ا ة ببتيأليااة واحااألة تتهااون ماان 153حمااض همينااي
ويب ااغ وتنااه الجتيئااي 16700يحتااو الميوج ااوبين ك اا ،مجموكااة ماايا ب ااا ذرة حأليااأل ومااي
مشاب ة لمجموكة ال يا الموجوألة ي ال يموج وبين والما ولة كن ال ون األحمار الغاامق لهاي
من ما
الألرااة التي اا العالا Kendrewوماااكألوه ك ا ،باروتين الميوج اوبين ألامات هه ار مان 10
ااانوات وه ماارت بااإ تراح البنيااة ال راغيااة ل ميوج ااوبين واااان مااذا الترايااب متطاتلااا مااع تا اااي
األحماض األمينية المألرواة بي ذلك وتتنمن بنية الميوج وبين المميتات التالية:
-1تتهااون الا ا ا ة الببتيأليااة ااي جاات ف الميوج ااوبين ماان 8مناااطق ذات ترايااب ح تونااي
54
ت سا ا ا نل اااي لإلنعط اااف ،حي اام يب ااغ نا ااتة التراي ااب الح تون ااي aحا اوالي % 70ااي ا ااي
الجاات ف يرماات ل مناااطق الح تونيااة تااأحرف ماان Aإلاا ، H ،امااا يرماات لونااعية الحمااض
األمينااي ااي المنطلااة ب ااحرف يشااير إلاا ،المنطلااة ي يااه ر ااا يشااير إلاا ،ونااع الحمااض األمينااي
ألا.ااي ن ا
المنطلااة ما A5 :هو D2امااا يرماات لمناااطق االنعطاااف تحاار ين يشاايران إلاا،
منطلة بي وتعأل ا نعطاف م AB :هو DE
تحتاو ههبار منطلاة ( )Hك ا 24 ،حماض هميناي بينماا تحتاو هساغر منطلاة ك ا)C, D( ،
ك 7 ،هحماض همينية لط
-2ياون جت ف الميوج وبين مترال ومااأل
ألا .ياا بألرجاة ابيارة ،ه اليوجاأل منااك مااا ة
ألا.ي الجت ف وتب غ إتعاأل الجت ف تلريتا A° 25x 35 x 45
-3هغ ااب الا اااي الجانبيااة المحتااة ل ماااف توجااأل ك اا ،الاااط ال.ااارجي ل بااروتين ك اا ،تمااا
مااع المح ااو ال.ااارجي بينمااا توجااأل هغ ااب الا اااي الجانبيااة الهارمااة ل ماااف ااي الج ااة الألا .يااة
تعيااألة كاان االتسااا تالماااف ممااا يااام ل ااا تالتجاااذب تلااوة والمااااممة بألرجااة ابي ارة ااي تااات
البنية ال راغية ل ميوج وبين
-4تتونااع مجموكااة ال اايا ااي جيااب ألا.ااي جاات ف البااروتين وتحتااو
55
ااي مراتمااا ك اا ،ذرة
الحأليأل ترتتط مجموكة ال يا بجتيئتين من ال اتألين مما F8و E7
-5يحتور الميوج وبين ك 4 ،جتيئاات بارولين Proتوجاأل ا اا اي منااطق ا نعطااف ،اماا
تحتا ااو منا اااطق ا نعطا اااف األ.ا اارر ك ا اا ،هحما اااض همينيا ااة ه.ا اارر ال تتنااا ااب ما ااع الترايا ااب
الح توني إذا وجألت متلاربة من تعن ا م ي Thr, Ser, Asn
تعااأل الأل اراااة التااي هجرياات ك اا ،الميوج ااوبين اماات أل اراااات ك اا ،بروتينااات ه.اارر مامااة م ااي
اايتواروا (Cytochrom C) Cو إناتيا ريبرنيوا ياات ribonucleaseو إناتيا ال يااوتيا
lysozymeوالتي تحتو ا ا ك ،ا ا ة ببتيألية واحألة (بنية ال ياة) ومان .ا
الأل ارااات
المتعا تااة وجااأل هن لهااي بااروتين ماان مااذه البروتينااات بنيااة .اس اة ب اا وتا اااي .ااال يعا ا
الولي ة الم.ت ة لهي من ا
بروتين الهيموجلوبين )Hemoglobin (Hb
تعاأل تحألياأل التراياب ال ارغاي ل ميوج اوبين ااا العالماان Max Perutzو John Kendrew
ومااكألومما بألرااة الترايب البنائي ال ارتاع ل يموج اوبين و األ تاا تحألياأل ذلاك اي اانة 1959
واان بذلك ال يموج وبين هو بروتين ذو ترايب راتع يتا تحأليأل ترايته البنائي
يأ .ااذ ج اات ف ال يموج ا ااوبين ش ااا ارويا ااا تلريت ااا ( طا اار 5.5ن ااانومتر) ويب ا ااغ وتن ااه الجتيئاااي
64500ويتهون من 4ا اي ببتيألية يحتو اي من ا ك ،مجموكاة مايا وذرة حألياأل الجاتف
البروتيني من ال يموج وبين يتهون من ا ا تين aتحتو اي من اا ك ا141 ،حماض هميناي
وا ا تين تحتو اي من ا ك 146 ،حمض هميني
ا ا ة ببتيألية
مجموكات ال يا
ا ا ة ببتيألية
56
ا ا ة ببتيألية
مجموكات ال يا
ا ا ة ببتيألية
تش ااته البني ااة ال راغي ااة ل ا اا ااي و ل يموج ااوبين ا يا ا ار بنيا ااة الميوج ااوبين م ااع تعاااض
ا .اات ف ااي التا ا ااي تتون ااع الا ا ااي و م ااع تعنا ا ا ااي ش اااي م اارا رب اااكي
وتحااا أ ك اا ،تماا ااا ا بواا ااطة تجاااذب هطا اراف اارم ااة ل م اااف ك اا ،الا ااط ال .ااارجي ل ااذه
الا ا ااي ،ام ااا توج ااأل روات ااط م حي ااة ا ااذلك ناتج ااة م اان تج اااذب الش ااحنات المتعاها ااة تل ااع
مجموكات ال يا ألا.ي جيوب تعيألة كن تعن ا ك ،اط جت ف ال يموج وبين
أهمية التسلسل في تحديد وظيفة البروتين
لمعر ة تأ ير تا اي األحماض األمينية ي ولي ة البروتين نلوا بألرااة نوع من ال .ي
الو ار ي الذ يسيب ال يموج وبين والمعروف تمرض األنيميا المنج ي :
البروتينات الليفية ()Fibrous proteins
تأ .ااذ ش اااي هلي اااف وتا ا أل هألوار ترايبي ااة م.ت ااة وتمت ااات تالسا ا تة هو تالمرون ااة هو تا مم ااا
حااب الاألور الترايباي الاذ ي ألياه الباروتين تتميات ااذلك بترايب اا التاايط ملارناة تالبروتيناات
الهروية ،تعألا الذوتان ي الماف لوجوأل كألأل ابير من األحمااض األمينياة الهارماة ل مااف ك ا،
الا ااط ال ااألا .ي وال .ااارجي ل ب ااروتين تمت ااات تع ااض م ااذه البروتين ااات ا ااذلك بإحتوافم ااا ك اا،
الرواتط التااممية بين الا اي الببتيألية ل محا لة ك ،ترايب ا البنائي
تتنااوع هألوار مااذه البروتينااات حاااب تنااوع ترايب ااا البنااائي ممااا يشااير إلاا ،الع ااة بااين الترايااب
57
والولي ة
ومن هما مذه البروتينات :الهيراتينات و الهوالجينات
الهيراتينات : Keratenesومي نوكان و
أ -الكيراتينات : ومي البروتيناات األااااية اي حماياة هجاااا ال لارياات ،حيام تهاون ااي
الوتن الجاف تلريتا ل شعر ،السوف ،الاريش ،األناا ر ،الم.الاب ،الح ارشاي ،اللارون ،
الحوا ر تا نا ة إل ،وجوألما ي الطتلة ال.ارجية ل ج أل تتميت تعألا الاذوتان اي المااف له ارة
الا اي الهارمة ل ماف م ي Phe, Ile, Valك ،الاط ال.ارجي ل ا ا ة الببتيألية
تتهااون الهيراتينااات ماان الترايااب الح تونااي aلااذلك ال تحتااو ك اا ،الباارولين Proامااا
تحتااو الهيراتينااات ك اا ،حمااض الاياااتايين Cysبناااب م.ت ااة ممااا يااام ل ااا بتهااوين
جاور نائية الهبريت تااما بألرجة هاااية ي تات ترايب ا البنائي
ماال :تركيب الشعرة
تتهون الشعرة مان ا ااي ببتيألياة ذات تراياب ح توناي aت تاي ااي
ح تونيا نتاا حباي
اة من اا حاو تعنا ا
اي ياام ،ليياي هولاي protofibrilيحاا أ ماذا التراياب ك ا ،تا اه
لوجا اوأل جا ااور نائي ااة الهبري اات يتجم ااع 11ليي ااي هول ااي ااي حتم ااة نت ااا ال يي ااي ال ااأل يق
microfibrilالتااي تتجمااع بااألورما ااي حااتا نتااا ال يااي macrofibrilتحتااو الملطااع
العرن ااي ل ش ااعرة ك اا ،مجموك ااة م اان ال .ي ااا تحت ااو ا ااي من ااا ك اا ،مجموك ااة م اان األلي اااف
macrofibrilsاما تحاي الشعرة تطتلة امياة من األألمة
.يا
ليي ات
لييي هولي
لييي أل يق
58
إلتفاف حلزوني لسالسل ذات
بنية حلزونبة
سلسلة ذات بنية
حلزونبة
بنية الشعرة
ت.ت ي الهيراتينات ي س بت ا وألرجاة ملاومت اا حااب محتواماا مان Cysوتالتاالي نااتة
الجاور نائية الهبريت حيام تحتاو الهيراتيناات aالماوناة للو عاة الاا ح اة ك ا 18% ،مان
Cysومي ناتة كالية
ب -الهيراتينات :
تتهون هاااا من البنية ال انوية وتعطي تراياب األوراا المنطوياة ،غيار اب اة ل اذوتان اي
الماااف وتمتااات تمرونت ااا وكااألا اب ت ااا لإلاااتطالة ك اا ،كاا
الهيراتينااات aالتااي يمااان ل ااا هن
تاتطيي إل ،نعي طول ا تلريتا ي حالة الشأل والح اررة (اماا اي حالاة الشاعرة) لتسات
ريتاة
من الترايب
الهيراتينات ه ي انتشا ار من الهيراتينات وتهاون الجاتف األااااي لباروتين ال باروين المااون
ل حرير و.يوي العنابوت ال تحتو الهيراتينات ك ،الجاور نائياة الهبريات وانماا تحاا أ
ك ،ترايب ا تالرواتط ال يألروجينية بين الا اي الببتيألية اما رهينا ااتلا
الكوالجينات : Collagenes
مي هما البروتينات ال ي ية نل ار له رة إنتشارما ي األناجة الحيوانية و.اساة اي ال األييات
وم ااي الماون ااات الرئيا ااية لانا ااجة الن ااامة connective tissueالت ااي تا ا أل ون ااائي
ألكامية تا نا ة إل ،كم ياة الاربط باين ال .ياا واألنااجة توجاأل ماذه البروتيناات اي العلااا
،الغن اااريي ،األوت ااار ،واألربط ااة ،ام ااا ته ااون غا ا ف األوكي ااة الألموي ااة ،األنا ااجة تح اات
59
الج ألي ا ا ااة والا ا ا اربط ب ا ا ااين ال .ي ا ا ااا ألا .ا ا ااي النا ا ا ااج تا ن ا ا ااا ة ته ا ا ااوين الم ا ا اااألة ب ا ا ااين ال .وي ا ا ااة
extracellular matrixي.ت ااي ترايااب اله اوالجين حاااب نااوع الولي ااة التااي يلااوا ب ااا ،
اما تتميت هلياف الهوالجين النانجة تالس تة تمان ا من تحمي وة شأل ابيرة جألا
60
Télécharger le fichier (PDF)
Doc3 AA et Protéines.pdf (PDF, 1.5 Mo)