Doc4 ENZYMES .pdf
Nom original: Doc4 ENZYMES.pdfTitre: الإنزيمات Les enzymes بعد دراستنا للبروتينات بصورة عامة في الباب السابق نركز الإهتمام في هذا الباب على أهم قسم من البروتيناتAuteur: karim
Ce document au format PDF 1.5 a été généré par Microsoft® Word 2013, et a été envoyé sur fichier-pdf.fr le 24/12/2016 à 14:24, depuis l'adresse IP 105.98.x.x.
La présente page de téléchargement du fichier a été vue 544 fois.
Taille du document: 775 Ko (28 pages).
Confidentialité: fichier public
Aperçu du document
اإلنزيمات Enzymes
بعد دراستنا للبروتينات بصورة عامة في الباب السابق نركزز االهتمزا فزي هز ا البزاب علزم هز
قس من البروتينات وهي اإلنزيمات .تعمل اإلنزيمات علم سير التفاعالت فزي اننممزة الة زة
وتمتززاز بالفعال ززة والسززرعة باإللززافة صلززم الت ص ز
ات هم ة كبيرة.
الكبيززر فززي العمززل ممززا يكعلتززا مركبززات
صن د ارسززة اإلنزيمززات وفتز مل ززة عملتززا مكننززا مززن فتز ولززب الومززا ب الةيو ززة التززي ت ززو بتززا
ال ال ا .فعمل ات االن سزا والتلزاعب نوانتزاو وةفزل الةاقزة وكز ا الزدورات الةيو زة الم تلفزة و
بن ززال البروتين ززات وانورز ز ة وويره ززا مز زن المركب ززات التام ززة كلت ززا عمل ززات ت ززو بت ززا صنزيم ززات
م تلفززة .باإللززافة صلززم لززم فاإلنزيمززات قابلززة للتنمز للتكيززب مز مززرو
الوسز واةت اكززات
الكززا ن .وبصززورة عامززة فززفن المةافمززة علززم الة ززاة فززي ال ل ززة هززو نتيكززة عمززل منسززق مةك ز
لعدد كبير كدا من اإلنزيمات.
صن لدراسة اإلنزيمات ك لم هم ة كبيرة من الناة زة التةب زة ف فتزو فيزدنا فزي فتز ومعالكزة
الكثير من انمراض الناتكة من لزل فزي عمزل اإلنزيمزات نسزباب فيزيولوك زة و وراث زة .كمزا
ن ق اس نراط بعض اإلنزيمات في سوا ل الكس عد مؤر ار هاما لتر
بعزض انمزراض
و عالكتززا .و تسززت د اإلنزيمززات ةال ززا فززي م ززادين كثي زرة ومتنوعززة فززي الصززناعات الك م او ززة
والغ ا ة وفي الزراعة باإللافة صلم است دامتا في التندسة الوراث ة في ن ل ورب المورثات.
واإلنزيمات هي بروتينات تصن دا ل ال ال ا وتتميز بمايلي :
-1ال درة الكبيرة في اإلسراع من التفاعالت الك م ا ة
-2الت ص
الكبير في العمل
-3عملتا قابل للتنم لالستكابة لمتةلبات الة اة دا ل ال ل ة.
-4ال يؤثر اإلنزي علم تغيرات الةاقة وال علم ثابت االتزان.
61
-5كون تركيز اإلنزي صغير كدا م ارنة بتركيز المادة التي عمل عليتا.
العوامل المؤثرة علم نراط اإلنزي :
-1تركيز اإلنزي :يتناسب نراط سسزرعةا اإلنززي ةزردا مز تركيزز اإلنززي ف ةيز
يتلزاعب
النراط بتلاعب التركيز.
-2الة اررة :لكل صنزي دركة ة اررة كون عنزدها النرزاط عمم زا وتسزمم بدركزة الةز اررة المثلزم
.optimal temperature
: pH -3لكززل صنززي دركززة pHمثلززم كززون عنززدها النرززاط عمم ززا .بعززض اإلنزيمززات تكززون
كثززر نرززاةا فززي انوسززاط الةامل ز ة وبعلززتا كززون نرززةا فززي انوسززاط ال اعد ززة .والززبعض
اآل ر في انوساط المتعادلة.
تسمية وتقسيم اإلنزيمات
لكززل صن ززي صس ز
ززا
بززا ف فززبعض اإلنزيمززات تع ز صس ز المززادة التززي تعمززل عليتززا بفلززافة
الم ة ز زازز زaseز مثززل يوريززاز ureaseو ركينززاز arginaseو ATPaseلكززن بعززض
اإلنزيمات لتا سمال العالقزة لتزا بمزواد التفاعزل مثزل صنززي تربسزين و ك موتريبسزين .صن هز
ال اعززدة فززي التسززم ة ل سززت دق ززة وقززد دت فززي الكثيززر مززن الةززاالت صلززم صعةززال نفززس االس ز
إلنزيمززات م تلفززة و سززمال م تلفززة لززنفس اإلن ززي .ونم ز ار للزيززادة الكبي زرة فززي عززدد اإلنزيمززات
المكترززفة كززل يززو ولتفززاد االلتبززاس الموكززودة فززي ةري ززة التسززم ة الت ليد ززة ت ز اعتمززاد نمززا
علم ززي وع ززالمي لتس ززم ة وت سز ز اإلنزيم ززات مم ززا مك ززن العلم ززال م ززن تص ززنيب والتع ززر عل ززم
اإلنزيمات.
عتمزد هز ا النمزا علزم ت سز اإلنزيمزات صلزم 6قسزا ر سز ة لز كزل منتزا عزددا مزن تةززت
انقسزا كمزا لز كزل قسز عزددا مزن تةزت تةزت انقسزا والتزي لز كزل منتزا مكموعزة مززن
اإلنزيمات ت تلب في نوع المادة التي عمل عليتا اإلنزي .
كما يت في ه ا النما تسم ة اإلنزيمزات باسز علمزي يتكزون مزن كززين ةزدهما عزدد مكزون
مزن 4رقزا
مثزل كزل منتزا علزم التزوالي سمزن ال سزار صلزم ال مزينا ف رقز ال سز وتةزت ال سز
62
وتةززت تةززت ال سز ثز اإلنززي بينمززا يتكززون الكزززل الثززاني مززن صسز علمززي مفصززل ةتززو علزم
نوع التفاعل ونوع مادة التفاعل.
مكونات اإلنزيم
ولزب اإلنزيمزات التزي تمزت تن يتتززا لةزد اآلن هزي بروتينزات تتززعثر بزنفس العوامزل المزؤثرة علززم
البروتينات ويرتب عملتا بالمةافمة علم بن زة وتسلسزل انةمزاض انمين زة .وت سز اإلنزيمزات
من ةي
المكونات صلي قسمين :
-1صنزيمات بس ةة تتكون من ةماض مين ة ف .
-2صنزيمز ززات مركبز ززة تتكز ززون -باإللز ززافة صلز ززم انةمز ززاض انمين ز ززة -مز ززن مكموعز ززات ويز ززر
بروتين ززة و يونززات و كالهمززا .سززمم الكزززل ويززر البروتينززي بالعامززل المسززاعد cofactorو
مسززاعد اإلن ززي coenzymeف وقززد كززون المسززاعد يززون مثززل الةديززد +Fe2الزنززم Zn+2ف
النةزاس Cu+2و علزو مثزل NAD+و .Co-enzyme Aكمزا سزمم الكززل البروتينزي
مز ززن اإلن ز ززي بز ز ز Apoenzymeو كز ززون الكز زززل البروتينز ززي وويز ززر البروتينز ززي اإلن ز ززي الكامز ززل
.Holoenzymeيززت تصززن
العديززد مززن المسززاعدات اإلنزيم ززة فززي الكس ز مززن الفيتامينززات
الموكودة في الغ ال.
الموقع الفعال لإلنزيم actif site
وهو المنة ة من اإلنزي التي ترتب بتا مزادة التفاعزل والتزي تةتزو علزم انكززال التزي ترزارم
في التفاعل مباررة .و متاز الموق الفعال لإلنزي بمايلي:
-1ع ز ةيززز صززغير مززن اإلن ززي ف
مباررة.
-2ع
ن ولززب انةمززاض انمين ززة ال ترززارم فززي التفاعززل
ركل ثالثي انبعاد وقد يتكون مزن ةمزاض مين زة بعيزدة عزن بعلزتا فزي التسلسزل.
فززفنزي اللي ززوزي مززثال يتك زون موقعززا النر ز مززن انةمززاض انمين ززة 35ف 52ف 62ف 63ف
101ف .107
63
-3تكون الرواب بين مادة التفاعل واإلنزي في الموق الفعال لع فة ستل تكسيرها.
-4هنززام تكامززل فززي الرززكل الف اروززي بززين مززادة التفاعززل والموقز الفعززال لإلن ززي رززبا التكامززل
بززين ال فززل والمفتززاب .فززي بعززض اإلنزيمززات كززون ه ز ا التكامززل موكززودا فززي وكززود وفززي و ززاب
مادة التفاعل بينما يت التكامل في بعض اإلنزيمات ف ز عنزد صقتزراب مزادة التفاعزل التزي تةفزز
اإلنزي لتغيير ركلا الفراوي ف صبح مكمال لركل مادة التفاعل .
حركية التفاعالت اإلنزيمية enzyme kinetics
وهززي د ارسززة سززرعة التفاعززل وتغيراتتززا م ز الرززروط التكريب ززة إلسززتنتاو العديززد مززن صززا
اإلنزي وةري ة عملا .ومن بس ةرق دراسة ةرك ة اإلنزيمات هو دراسة العالقة بين سزرعة
التفاعل وتركيز مادة التفاعل.
عنززد رس ز العالقززة بززين التركيززز الم زوالر لمززادة التفاعززل ]Sو السززرعة اإلبتدا ززة Voنةصززل
علززم منةنززم برززكل قة ز نززاق
. hyperbolicفززي التراكيززز المن فلززة لز ز Sتكززون هنززام
عالقززة ة ززة بززين ]Sو Voوفززي التراكيززز العال ززة ت ززل الزيززادة فززي Voتززدريك ا صلززم ن ةززة
تتوقب فيتا Voعن الزيادة رو زيادة ]Sوتسمم ه بالسرعة ال صوى .Vmax
تز صقتزراب هز الةرك زة مزن ةزر العالمزان Leonor Michaelisو Maud Mentenفزي
1913و عتمد ه ا االقتراب علم تكوين المع د ESكمرةلة وسة ة قبل صعةزال النزواتح ةسزب
المعادلة عال .
هنام دلة تكريب ة كثيرة تثبت وكود المع د ESمنتا:
-1تمكززن العلمززال مززن رؤ ززة المع ززد ESتةززت المكتززر اإللكترونززي فززي بعززض الةززاالت مثززل
المع د الناتح من صرتباط صنزي ADNبول مراز بمادة التفاعل سADNا عند التلاعب.
-2بفست دا ةيود انرعة السين ة لوةل فرق في تركيب اإلنزي في ةالة Eوالمع د .ES
-3ص ا كزان اإلنززي ةتزو علزم مكموعزة ويزر بروتين زة ات ةيزب صمتصزا
معزين ف فززفن
ه ا الةيب يتغير ثنال التفاعل مري ار صلزم صرتبزاط هز المكموعزة بمزادة التفاعزل ممزا لزل مزن
صمتصاصتا.
-4عززد تغي ززر الس ززرعة ف ززي التراكي ززز المرتفع ززة لمززادة التفاع ززل ر ززير صل ززم تر ززب اإلنز ززي بمززادة
64
التفاعل وهو دليل وير مبارر علم وكود المع د . ES
يتواكد اإلنزي عادة في صةزدى صزورتين :ةزرة Eومرتبةزة . ESفعنزد التراكيزز المن فلزة ل ز
Sتكون ولب كزي ات اإلنزي في الصورة الةرة Eبينما كون العكس في التراكيزز المرتفعزة ف
و صززبح اإلن ززي كلززا م زرتب ESعنززد Vmaxف وعنززد ه ز الن ةززة كززون اإلن ززي مرززب بمززادة
التفاعل Sبةي
ن زيادة ]Sال يؤثر علم السرعة.
للةصول علم المنةنم عمل زا يزت صلزافة تركيزز مةزدد وصزغير مزن اإلنززي لتركيزز عزالي مزن
مززادة التفاعززل Sف وبعززد المرةلززة اإلبتدا ززة الس زريعة كززدا يكززرى التفاعززل فززي مززرو
ةرك ززة
ثابتة سعند Vmaxا ف لز لم فزفن الةرك زة المدروسزة هنزا هزي ةرك زة الةالزة الثابتزة steady
. state kinetics
السرعة االبتدائية
تركيز مادة التفاعل
مكن التعبير عزن العالقزة السزاب ة بزين ]Sو Voكم زا بمعادلزة تعزر بمعادلزة م كزا يل س -
منتن :Michaelis-Menten equation
ةيز
KMثابززت م كززا يل س-منززتن ال ز
عنززد ص ززتال
ت تلززب ق متززا مززن صن ززي آل ززر وةتززم لززنفس اإلن ززي
مززادة التفاعززل .و مكززن مززن العالقززة السززاب ة صيكززاد صز غة
الثابت كما يلي :
65
ززرى للتعبيززر عززن هز ا
]Km = ]S
مززن ززالل العالقززة السززاب ة مكززن تعريززب Kmبعنززا تركيززز مززادة التفاعززل ]Sعنززدما تكززون
السرعة اإلبتدا ة Voمساو ة لنصب السرعة ال صزوى Vmaxف ومزن لزم فزفن Kmعبزر
عنززا بوةززدات التركيززز سمززول لا .تت زراوب ق مززة Kmنولززب اإلنزيمززات بززين 10-1و 10-7
مول لتر سالكدولا .
قيم Kmلبعض اإلنزيمات المعروفة بالنسبة لمواد التفاعل
مادة التفاعل
تعبر ق مة Kmعن مدى كا ب ة اإلنزي لمادة التفاعل Sةي
إسم اإلنزيم
تتناسب ق مة Kmعكسزا مز
ه الكا ب ة ف ل لم ففن نفس اإلنزي قد تكون لا كا ب ة م تلفة لمواد التفاعل الم تلفة.
مكن تةويل عالقة م كا يل س -منتن كبريا صلم صورة كثزر فا زدة مزن الناة زة العمل زة و لزم
بفيكاد العالقة بين م لوب Voو م لوب . ]S
66
الةل ن العالقة ة ة مزن النزوع
عس س +ب وتسزمم بفسز العزالمين Linweaverو
Burkال ز ين صسززت ركا ه ز العالقززة نول م زرة .بمززا ن العالقززة ة ززة ففنتززا تسززمح بتةديززد
دقيززق ل متززي KMو Vmaxو لززم مززن ن ززاط ت ززاة المنةنززم ال ةززي مز المةززور العمززود
وانف ي سالركلا .
هنام مصةلح م ر هزا فزي علز اإلنزيمزات سزمم رقز التةزول turnover numberويرمزز
لا بالرمز kcatوهو عدد كزي ات مادة التفاعل المةولة بواسةة كز ل واةد من
اإلنززي فززي وةززدة الزززمن عنززدما كززون اإلنززي مرززب بمززادة التفاعززل .و مكززن ةسززاب هز ا الززرق
من العالقة التال ة:
ةي
]ET]= [E] + [ES :
و كون لكل صنزي رق تةول ا
صلم نواتح سالكدولا.
با عبر عن مزدى سزرعة اإلنززي فزي تةويزل مزادة التفاعزل
67
ق Kcatلبعض اإلنزيمات المعروفة
إسم اإلنزيم
مادة التفاعل
عتبزر Kmو Kcatمؤرزران هامزان فزي د ارسزة اإلنزيمزات وم ارنزة نرزاةتا ةيز
منتمززا صلززم صززا
رزير كززل
م تلفززة يتميززز بتززا اإلنززي .ونمز ار لز لم صقتززرب بعززض العلمززال صسززت دا
كال المؤررين معا للداللة بصورة راملة علم مدى فعال ة اإلنزي .
عندما كون ]Sصغير كدا م ارنة م
Kmففن معادلة م كا يل س تصبح كما يلي:
عيتبززر بع ززض العلم ززال ن النس ززبة ب ززين Kcatو Kmه ززي مؤر ززر كث ززر دالل ززة عن ززد م ارنززة
فعال ة اإلنزيمات ف اصة في الرروط ال لو ة التزي ت تلزب كثيز ار عزن الرزروط التكريب زة فزي
الم بر .وتتراوب ق مة ه ا المؤرر بين 810و . 910
قيم Kcatلبعض اإل نزيمات المعروفة
مادة التفاعل
68
إسم اإلنزيم
المثبطات اإلنزيمية Inhibitors
المثبةززات اإلنزيم ززة هززي مركبززات و يونززات توقززب و ت لززل مززن نرززاط اإلن ززي ف ووالبززا مززا
كون ه ا التثب
عامل تنم في اننممة الة ة .و مكن تل
مايلي :
-1توفر معلومات هامة ةول ت ص
هم زة د ارسزة المثبةزات فزي
اإلنزيمات.
-2تةديد نوع المكموعات الفعالة في الموق النر لإلنزي .
-3التعر علم مل ة عمل اإلنزيمات.
-4لت ززا هم ززة كبيز زرة كعدو ززة لوق ززب نر ززاط صنزيم ززات تل ززر بص ززةة اإلنس ززان ف سز زوال كان ززت
اإلنزيمات تابعة لإلنسان و لكا ن مسبب للمرض .ومن مثلة رتر المثبةات البنسزيلين الز
يثب اإلنزيمات المصنعة لكدار البكتريا مما من تلاعب البكتريا وتكاثرها.
-5د ارسززة الززدورات الةيو ززة فززي الميتززابوليز وتسلسززل التفززاعالت فيتززا ال مكززن ن يززت بززدون
االستعانة بالمثبةات.
ت س المثبةات عادة صلم نوعين :عكس ة reversibleووير عكس ة . irreversible
-1التثبز
ويزر العكسزي :Irreversible Inhibitionوف زا يزرتب المثزب بزاإلنزي بصزورة
قو ززة س تسززاهم ة والبززا ا ال ينفصززل عنززا صال بصززعوبة .وقززد اسززتعملت هز المثبةززات كمزواد
سامة قاتلة مثل وازات انعصزاب المسزت دمة فزي الةزروب الك م او زة ف وهزي مثبةزات توقزب
نراط صنززي acetylcholineesteraseانساسزي فزي ن زل السز الة العصزب ة .مزن رزتر هز
المثبة ز ز ز ز ز ز ز ززات ه ز ز ز ز ز ز ز ززو مرك ز ز ز ز ز ز ز ززب ثن ز ز ز ز ز ز ز ززا ي صي ز ز ز ز ز ز ز زززو بروبي ز ز ز ز ز ز ز ززل فس ز ز ز ز ز ز ز ززفوفلوريد
)(DIPF
isopropylphosphoflorideال ز ز
Di-
ي ز زرتب بالسلسز ززلة الكانب ز ززة لةمز ززض Ser
الموكود في الموق الفعال وانساسي في عمل اإلنزي .
باإللزافة صلززم االسززتعماالت اللززارة مكززن للمثبةززات ويززر العكسز ة ن تسززتعمل فززي كثيززر مززن
الم ززادين النافع ززة مث ززل المبي ززدات الةرز زرية والفةري ززة ف وكز ز ا كعدو ززة لوق ززب نر ززاط اإلنزيم ززات
الملرة بصةة اإلنسان.
69
ومن ه و رتر انمثلة عن دور المثبةات كعدو ة هو مركب البنسيلين ال
زو بتثبز
نمزو
البكتريززا ننززا من ز تكززون الكززدران ال لو ززة ف ممززا يززؤد صلززم انفكززار ال ل ززة البكتيريززة ف نم ز ار
الرتف ززاع لز ززغةتا انس ززموز م ارنز ززة بالوسز ز ال ز ززاركي ود ززول كم ز ززة كبيز زرة مز ززن المةلز ززول
ال اركي .وقزد الةزل العلمزال ن ال ال زا البكتريزة الةساسزة للبنسزيلين مكنتزا النمزو دون كزدار
ص ا وكززدت فززي وس ز
سززاويتا ف ززي اللززغ انسززموز .isotonicعمززل البنسززيلين كمثززب
ويززر عكسززي لإلنززي ان يززر فززي م ارةززل تكززون كززدار البكتززر اف ننززا يزرتب تسززاهم ا بةمززض
Serفي الموق النر لإلنزي .
-2التثب
العكسي reversible inhibition
وف ا يرتب المثب باإلنزي بصورة لع فة ستل صنفصزالا ف وين سز هز ا النزوع مزن التثبز
صلزم
قسمين هما :
-التثب ز
التنافسززي : competetive inhibitionوف ززا يتنززافس المثززب ومززادة التفاعززل
عل ززم نف ززس الموقز ز النرز ز بةيز ز
يتك ززون صم ززا المع ززد ESو المع ززد EIوال مك ززن ن يتك ززون
المع ززد الثالثززي . ESIفززي ه ز الةالززة مززن التثب ز
كززون رززكل ستركيززبا المثززب مرززابا كثي ز ار
لركل مادة التفاعل مما يؤد صلم صرتباط المثب وولق الةريق ما صرتباط مادة التفاعل.
ب -التثب
وير التنافسي noncompetetive inhibition
وف ززا ي زرتب المثززب بززاإلنزي فززي موق ز ي تلززب عززن الموق ز الفعززال ممززا قززد يززؤد صلززم تكززوين
70
المع ززد الثالثززي . ESIو كززون اإلنززي فززي ةالززة ويززر نرززةة عنززد ارتبززاط المثززب سزوال فيوكززود
مادة التفاعل ESIو في و ابتا. EI
يوص ز ززب ف ز ززي بع ز ززض الكت ز ززب ن ز ززوع ثالز ز ز
uncompetetiveوي تلززب عززن التثبز
بعد صرتباط مادة التفاعل سيرتب ف
م ز ززن التثبز ز ز
العكس ز ززي س ز ززمم التثبز ز ز
الالعكس ز ززي
ويززر العكسززي فززي عززد قابليتززا لالرتبززاط بززاإلنزي صال
ب ESوال يرتب باإلنزي الةر Eا.
71
حركية اإلنزيمات في وجود المثبطات العكسية
عند رس منةنم م كا يل س-منتن و منةنم Linweaver & Burkفي وكزود وفزي و زاب
المثبةات نةصل علم ركال م تلفة من المنةن ات تمكننزا مزن التفريزق بزين التثبز
ووير التنافسي بستولة وه ا بان
بعين اإلعتبار صا
-1وكود المثب التنافسي تتغير ةرك ة اإلنزي سالركلا .
التنافسزي
كل منتما.
في وجود المثبط
التنافسي
في غياب المثبط
1
-Km1
نالةل نا مكن التغلب علم التثب
التنافسزي بزيزادة تركيزز مزادة التفاعزل ةيز
تب زم السزرعة
ال صزوى Vmaxثابتززة فززي التراكيززز العال ززة ل ز .]Sعززود هز ا صلززم ةب عززة التنززافس بززين المثززب
ومادة التفاعل ةي
كون التنافس دا ما لصالح المادة ات التركيز العالي .
الة ززل كز ز لم م ززن المنةن ززم زي ززادة ف ززي ق م ززة KMمم ززا ر ززير صل ززم ن كا ب ززة اننز ززي لم ززادة
التفاعل ت ل في التراكيز المن فلة لز . ]S
72
رى سركل 7-3ا .
-2ما في وكود الثب وير التنافسي ففن المنةن ات تتغير بةري ة
نالةل من المنةن ات صن فزاض فزي ق مزة Vmaxو عزد تغيزر فزي KMوهز ا عزود صلزم
ن هنام عدد من كزي ات اإلنزي موكودة في ةالزة ويزر نرزةة فزي وكزود و فزي و زاب مزادة
التفاعز ززل.
ن التثب ز ز
ال يتز ززعثر بتركيز ززز مز ززادة التفاعز ززل ممز ززا يز ززؤد صلز ززم صن فز ززاض السز ززرعة
ال صوى Vmaxوعد تغير في .KM
من الل المنةن ات الساب ة و اصزة مزن المنةنزم ال ةزي مكزن بسزتولة التفريزق بزين التثبز
التنافسي ووير التنافسي من م ارنة ق
Vmaxو . Km
في وجود المثبط
غير التنافسي
1
Vmax1
في غياب المثبط
اإلنزيمات ثنائية الركيزة bisubstrate enzymes
في الكثير مزن الةزاالت الةب ع زة رزترم فزي التفاعزل نزوعين و كثزر مزن مزواد التفاعزل تزرتب
بكز ل اإلنزي .
م ززثال :ف ززي تفاع ززل فس ززفرة الكلوك ززوز بواس ززةة صنز ززي هكس ززوكيناز ) (HKك ززون الكلوك ززوز و
ATPمواد تفاعل لإلنزي .يت في ه التفاعالت عادة تةويل مكموعزات ك م ا زة مزن مزادة
تفاعل صلم
رى مما يتةلب صرتباةتما باإلنزي ف وقد اقترةت عدة ةرق لك ف ة صرتبزاط مزادتي
التفاعل.
73
-1الطريقةةةة العئةةةوائية :ف ززي هز ز الةال ززة ك ززل اةتم ززاالت ترتي ززب االرتب ززاط ممكن ززة سترتي ززب
اإلرتب ززاط وي ززر متز ز ف ززي ة ززدو التفاع ززلا ف ةيز ز
ت ززؤد كلت ززا صل ززم تك ززوين المع ززد الثالث ززي
. ES1S2
-2الطريقةةةة المتتابعةةةة :فززي هز ز الةالززة يك ززب صرتبززاط م ززادتي التفاعززل وف ززق ترتيززب مةززدد
وبدونا ال مكن للتفاعل ن يت .
الطريقة (اآللية) العئوائية
الطريقة المتتابعة
-3طريقة التناوب في اإلرتباط و ما عر بآل ة البنغ-بونغ ping-pongف في ه الةالزة
تزرتب مززادتي التفاعززل بةري ززة متناوبززة ةيز
تزرتب المززادة انولززم ثز تزرتب الثان ززة مبارزرة بعززد
صنفصال انولم .يت في ه ا النزوع مزن التفزاعالت نززع مكموعزة ك م ا زة مزن الركيززة انولزم ف
تب ززم هز ز المكموع ززة مرتبة ززة ب ززاإلنزي بع ززد صنفص ززال الركيز ززة انول ززم ف ززي ص ززورة ن ززاتح ول.
تلا
المكموعة الك م ا ة صلزم الركيززة الثان زة بعزد صرتباةتزا بزاإلنزي إلعةزال النزاتح الثزاني
.
طريقة (آلية) التناوب أو مايعرف بآلية البنغ بونغ
74
تعتب ززر اإلنزيم ززات الناقل ززة ل م ززين aminotransferasesم ززن ر ززتر اإلنزيم ززات الت ززي تعم ززل
بالةري زة المتناوبززة ف ةيز
صلي ةمض كيتزوني وتلزا
يززت نززع مكموعززة انمزين مززن الةمزض انمينززي انول الز
يتةززول
مكموعزة انمزين صلزم ةمزض كيتزوني م زر إلنتزاو ةمزض مينزي
مناسززب .هز التفززاعالت ساسز ة فززي ميتززابوليز انةمززاض انمين ززة ف وسززو
نعززود صليتززا عنززد
دراسة الميتابوليز .
اإلنزيمات المنظمة Allosteric enzymes
صن ةدو التفاعالت المع دة دا ل ال ل ة فزي من واةزد يتةلزب وكزود مل زة مةكمزة ودق زة فزي
التنم ز ز ف تز ززت ساسز ززا بواسز ززةة صنزيمز ززات مز ززن نز ززوع ز ززا
المنممة .ترمل عمل ة التنم كانبين هما :التنر
وقابلز ززة للتنم ز ز تسز ززمم اإلنزيمز ززات
والتثب ف و كزون لزم عزن ةريزق صرتبزاط
منم باإلنزي في موق ي تلب عن الموق الفعال سمم موق التنم
. regulatory site
تتميز اإلنزيمات المنممة عن اإلنزيمات ان رى بمايلي :
-1تتكون من عدة سالسل ببتيد ة ستةت وةداتا.
-2تةتو نوعين من المواق سمواق فعالة ومواق تنم ا .
-3تتعثر بمؤثر واةد و عدة مؤثرات صيكاب ة و سلب ة سمنرةات و مثبةاتا .
-4ال تتب ةرك ة م كا يل س سال تعةي منةنم م كا يل سا.
-5المزؤثرات السززلب ة و اإليكاب زة قززد تكزون مزواد تفاعزل ف نزواتح ف مسزاعدات صنزيم ززة و مزواد
رى.
-6قد يتغير التركيب البنا ي الراب قل ال و تتعثر تةزت الوةزدات ببعلزتا عنزد صرتبزاط المزؤثر
السلبي و اإليكابي.
حركية اإلنزيمات المنظمة
عنزد رسز العالقزة بزين Voو ]Sنةصزل علزم منةنزم برزكل ةزر
مززن ال ة ز المكززافيل hyperbolicال ز
) Sigmoïd (Sبزدال
نةصززل عل ززا فززي اإلنزيمززات العاد ززة التززي تتب ز
75
ةرك ة م كا يل س .
صن صرتباط المؤثر السلبي و اإليكابي يؤثر علم العالقزة بزين Voو ]Sةيز
يتكزا المنةنزم
صلم ال مين و ال سزار سرزكل 9-3ا ممزا يزؤثر علزم كا ب زة اإلنززي لمزادة التفاعزل س رزبا تزعثير
pHعلم ترب Hbبانكسكينا.
هنام ةرق
رى كثيرة لتنم عمزل اإلنزيمزات سزو
نزدرس مثلزة مفصزلة عنتزا فزي عمل زات
اإلسززت الب الم تلفززة .ومززن ه ز ه ز الةززرق مززا عر بززالتنم عززن ةريززق اإلرتبززاط التسززاهمي
76
السلسلة الجانبية للحمض
Ser14
األميني Ser14
فسفوريالز غير
نئط )(b
Phosphorylase
Kinase
Phosphorylase
Phosphatase
العكسززي covalent modificationمثززل الفسززفرة العكس ز ة فززي صن ززي الفوسززفوريالز المةلززل
للكل كززوكين ف الز
يتةززول مززن الصززورة ويززر النرززةة ) (bصلززم الصززورة النرززةة ) (aبفرتبززاط
الفسفات بالموق النر لإلنزي ف و ةد
العكس عند انفصال الفسفات.
كما يت تةويل الكثير من اإلنزيمزات مزن صزورة املزة صلزم صزورة نرزةة بواسزةة نززع قةز
ببتيد ززة مززن اإلن ززي .تعتبززر اإلنزيمززات المةللززة للززرواب الببتيد ززة proteolytic enzymes
سك موتربسززين وتربسززين مززثالا مززن هز مثلززة هز ا النززوع مززن اإلنزيمززات والتززي تصززن فززي صززورة
املة سزيموكين zymogeneا ف ثز تتةزول عنزد الةاكزة صليتزا صلزم صنزيمزات نرزةة بعزد نززع
كزال ببتيد ة.
77
األنظمة اإلنزيمية
وهززي مكموعززة مززن اإلنزيمززات تعمززل مز بعلززتا فززي سلسززلة مززن التفززاعالت المتتابعززة إلعةززال
ناتح نتا ي ف وفي هز السلسزلة كزون نزاتح اإلنززي انول هزو مزادة التفاعزل لإلنززي الثزاني فزي
السلسلة وهك ا. ..
يوكززد فززي ه ز اننممززة صن ززي واةززد علززم انقززل ززو بتنم ز السلسززلة ف و سززمم ه ز ا اإلن ززي
بالمةززدد للسززرعة . pace makerعززادة مززا كززون اإلن ززي انول فززي السلسززلة منممززا يتل ززم
صرززارات عززن كم ززة النززاتح النتززا ي ليزيززد و لززل مززن سززرعتا ف و لززم لغززرض تلب ززة ةاك ززات
ال ل ززة مززن ه ز ا النززاتح .سززمم ه ز ا النززوع مززن التنمز بززالتنم بواسززةة النززاتح النتززا ي feed-
. back control
عتبززر التثب ز
بواسززةة النززاتح النتززا ي feed-back inhibitionمززن ه ز ةززرق التنم ز فززي
ال ل زة ةيز
تةتززاو صلفزا ال ل ززة ف فيتةزول النززاتح النتززا ي
سزمح بتصززن
المركزب بال ززدر الز
صلززم مثززب لإلن ززي انول فززي السلسززة عنززد صرتفززاع كميتززا فززي ال ل ززة ف ويزززول ه ز ا التثبز
صن فاض كم ة الناتح لزيادة صستتالكا من ةر ال ل ة.
ومن رتر انمثلة عن ه ا النوع من التنم هو سلسلة تصن
عنززد
ةمزض Ileمزن ةمزض Thr
فززي مسززة تفززاعالت متتابعززة .اإلنززي انول سززمم Threonine deaminaseف وهززو صنززي
مززنم سززتكيب لمسززتوى Ileف ةي ز
ززو باإلرتبززاط بززاإلنزي فززي موق ز التنم ز عنززد صرتفززاع
مسززتوا فززي ال ل ززة و فززي الوس ز ف مؤد ززا صلززم توقززب و تبززاةؤ نرززاط اإلن ززي
deaminaseوبالتالي توقب تصن
Thronine
ةمض . Ile
الةل العلمال ن صلافة Ileصلم الوس الغ ا ي للبكتريا يؤد صلم توقب تصن عا عزن ةريزق
تثب
صنزي .Thronine deaminase
قد تكزون السلسزلة اإلنزيم زة متفرعزة ف عمزل النزاتح النتزا ي علزم تثبز
78
ةزد و كزل الفزروع لتز
السلس ززلة ةس ززب ةاك ززة ال ل ززة .وق ززد ك ززون الن ززاتح النت ززا ي منر ززةا نول تفاع ززل ف ززي السلس ززلة
ستنر
بواسةة الناتح النتا يا
L-Threonine
E1 dehydratase
E2
E3
تثبيط بواسطة
الناتج النهائي
E4
E5
تن ة اإلنزيمات Enzyme purification
ترززمل عمل ززة تن ززة اإلن ززي نفززس ال ة زوات المتبعززة فززي تن ززة البروتينززات سصسززت ال
79
ف فصززل
وتن ةا بفسزتعمال نفزس الةزرق الموصزوفة سزاب ا فزي د ارسزة البروتينزات لغزرض الةصزول علزم
صنزي ن ي.
ةتززو م ة ز تن ززة صن ززي علززم عززدة م ارةززل يززت فززي كززل منتززا صسززت دا ةززرق م تلفززة مززن
الفصل ةسب صوص ات اإلنزي المراد تن يتا.
يت في تن ة اإلنزيمات عادة ت دير دركة الن اوة ومردود كل مرةلة مزن م ارةزل التن زة إل تبزار
مز ززدى فعاليتتز ززا .إلك ز زرال ه ز ز اإل تبز ززارات يكز ززب ق ز ززاس نرز ززاط اإلن ز ززي وتةديز ززد مز ززد ن ز ززاوة
المست ل
بفست دا المؤررات التال ة:
-1وة ززدة النر ززاط اإلنزيم ززي :وه ززي كم ززة اإلنز ززي الالزم ززة لتةوي ززل 1م كروم ززول م ززن م ززادة
التفاعل في الدق ة .وتسمم ه بالوةدة الدول ة سو.دا ). Unité Internationale (UI
-2النرززاط النززوعي ) : Specific Activity (Asوهززي عززدد الوةززدات الدول ززة فززي 1ملززغ
بروتين دا ل المست ل
ف و عتبر ه ا المؤرر م اس لدركة ن اوة المست ل
.
-3النرززاط النززوعي الكزي ززي :وهززو عززدد كزي ززات و م زوالت مززادة التفاعززل المةولززة بواسززةة
كز ل و مول واةد من اإلنزي في الدق ة و في الثان ة ف وهو ساو رق التةول .Kcat
ال تبززار فعال ززة مرةلززة معينززة م ززن م ارةززل التن ززة يكززر ةس ززاب دركززة الن ززاوة و لززم بم ارنززة
النر ززاط الن ززوعي لم ززرةلتين متت ززاليتين .وق ززد ي ززت ص تب ززار فعال ززة م ةز ز التن ززة بم ارن ززة النر ززاط
الن ززوعي آل ززر و ول مرةل ززة ف ززي التن ززة .كم ززا مك ززن ةس ززاب م ززردود مرةل ززة معين ززة و م ةز ز
التن ززة بم ارنززة النرززاط الكلززي للمسززت ل
الدول ة في الةك الكلي للمست ل
.
بززين مززرةلتين .والنرززاط الكلززي هززو عززدد الوةززدات
آلية عمل اإلنزيمات
صن الةص ززول عل ززم اإلنز ززي ف ززي ص ززورة ن ززة ثز ز د ارس ززة بنيت ززا الفراو ززة باس ززت دا ةري ززة ةي ززود
انرعة السين ة -كما رينا في ةالزة البروتينزات -تسزمح بد ارسزة مل زة عمزل اإلنززي ف وك ف زة
80
ارتبززاط اإلن ززي بمززادة التفاعززل علززم الموق ز الفع زال ف وك ف ززة التكامززل بززين البن ززة الفراو ززة لكززل
منتما .صن الوصول صلم مل ة عمل اإلنزي تعتبر النتيكة النتا ة من الدراسة والتزي تتةلزب كزل
المعلومززات المتززوفرة عززن اإلن ززي بمززا فززي لززم تسلسززل انةمززاض انمين ززة ف البن ززة الفراو ززة ف
ةرك ة اإلنزي وك ا العوامل المؤثرة علم نراط اإلنزي مزن رزرروط الوسز ومثبةزات ...صلز .
لفت مل ة عمل اإلنزي ن و بدراسة مثلة مرتورة عن صنزيمات تمت دراستتا بنوع من التفصزيل
وت صقتراب ةري ة عملتا من ةر علمال الك م ال الةيو ة.
صنزي الليزوزي Lysozyme
ززو اإلن ززي بتةليززل كززدار البكتريززا المتكززون مززن س زكريات متعززددة ف ممززا يززؤد صلززم صنفكززار
ال ل ة البكتيرية وموتتا نتيكة اللغ انسموز العالي دا ل ال ل ة البكتيرية.
الةل العال فلمنح Flemingن ول قةرات من مال اننب و من الزدموع علزم ةبزق مزن
البكتريا يؤد صلم تةلل البكتريا ال ريبة من مزال اننزب ف فاسزتنتح ن مزال اننزب ةتزو علزم
مززادة ملززادة للبكتريززا سززماها لي ززوزي .كمززا الةززل نفززس العززال ن ه ز ا اإلن ززي ويززر فعززال م ز
الكثيززر مززن البكتريززا اللززارة لإلنسززان ف ممززا دى بززا صلززم االسززتمرار فززي بةاثززا التززي ثمززرت
باكترا
ملاد ةيو
كثر فعال ة هو البنسيلين.
يتكون كدار البكتريزا التزي تتزعثر بالل سزوزي مزن سزكر متعزدد ةتزو علزم نزوعين مزن الوةزدات
البسز ةة هزي ) N-acetyl Glucoseamine (NAGو)N-acetyl muramate (NAM
.
تز زرتب وة ززدات NAGبوة ززدات NAMع ززن ةري ززق روابز ز
سالركل10-3ا.
س14ا ف ززي ص ززورة متناوب ززة
تز زرتب السالس ززل الس ززكرية ف م ززا بينت ززا بواس ززةة سالس ززل ببتيد ززة قص ززيرة ع ززن ةري ززق وة ززدات
. NAMززو اإلنز ززي بتةلي ززل الرابة ززة س14ا ب ززين C1لز ززوةدة NAMو C4لوة ززدة
81
NAGنن اإلنز ززي ال س ززتة
تةلي ززل الرابة ززة س1 4ا ب ززين C1لز ززوةدة NAGو C4
لوةدة NAMسالركلا .كما مكن إلنزي الل سوزي ن ةلل الرابةة س1 4ا فزي متعزدد
NAGمثل الكيتين .
البنية الفراغية لإلنزيم
يبلززغ الززوزن الكزي ززي إلن ززي الل سززوزي المسززت ل
مززن ب ززاض الب ز ض عنززد الززدكاو 14600
و ةتو علم 129ةمض ميني و 4كسور ثنا ة الكبريت ف ركلا ب لزو متز ار
دا ل زا ف
بعاد oA 30x30x45ف نسبة التركيب الةلزوني فزي الل سزوزي قزل مزن Hbو Mbف
كما ةتو الل سوزي علم مناةق مكونة من البن ة الثانو ة . تكزون السالسزل الكارهزة للمزال
صلم الدا ل والمةبة للمال صلم ال ارو.
صن ول ةززوة فززي د ارسززة مل ززة عمززل اإلن ززي هززو تةديززد الموق ز الفعززال وك ف ززة االرتبززاط بززين
اإلنززي ومززادة التفاعززل .ال ةتزو الليززوزي علززم مكموعزة ويززر بروتين ززة و يونزات فززي الموقز
الفعال تمكن من تةديد الموق الفعال علم كز ل اإلنزي .
82
البنية الف ارغية إلنزيم الليزوزيم بنموذج ئريطي
فززي ه ز الةالززة يلكززع العلمززال صلززم م ارنززة البن ززة الفراو زة لإلن ززي فززي وكززود وفززي و ززاب مززادة
التفاعل ف ليت بعد لم استنتاو مكان الموق الفعزال ورزكلا .صزعب د ارسزة المع زد ESننزا
ويززر ثابززت سالتفاعززل سزري كززداا ف لز لم سززت د مثززب تنافسززي و يززت صبةززال التفاعززل ب فززض
دركزة الةز اررة مزثال .عتبزر مركزب ثالثزي (NAG3) NAGمثزب تنافسزي إلنززي الل سزوزي
نن ززا ر ززبا كثيز ز ار م ززادة التفاع ززل لكن ززا ال يتفاع ززل صال يبةز ز ر ززديدف وق ززد تز ز باس ززت دامتا تةدي ززد
الموق الفعال وانةماض انمين ة التي ترارم في اإلرتباط و لم كما يلي:
-1يرتب NAG3دا ل فراغ علم سةح اإلنززي و ةتزل ةزوالي نصزفا عزن ةريزق روابز H
وك ا تكا ب انة ار
الكارهة للمال سالركلا .
ترتب COO-لةمض Asp101برابةة Hبزمكموعة OHفي NAGBفي الكربون C6
كمززا تز زرتب COO-لةم ززض Asp101برابة ززة H
الكربون C2
يرتب
NAGCبعربعة رواب Hكما يلي :
83
ززرى بز ززمكموعة NHف ززي NAGAفززي
تزرتب OHفززي C3ب زرابةتين :Hانولززم مز Oالةل ززي لز ز NAGBوالثان ززة م ز NHلةمض Trp63
-ت زرتب C=Oفززي C2برابةززة Hبمكموعززة NHفززي السلسززلة الببتيد ززة انصززل ة لةمززض
رق 59
ترتب NHفي C2برابةة Hبمكموعة NHفي السلسلة الببتيد زة انصزل ة لةمزض رقز107
ترتب OHفي C6برابةة Hبمكموعة NHفي السلسلة الكانب ة لةمض Trp62باإللززافة صلززم الززرواب التيدروكين ززة ةززد
.Trp57
تكززا ب ل ةرلززب الكارهززة للمززال بززين NAGBو
لما ا ال يتةلل NAG3رو نا متعدد NAG؟
اإلكابة كالت من المالةمة ن NAG6يتةلزل بسزتولة ننزا رزغل كزل الفزراغ دا زل الموقز
الفعز ززال ف بينمز ززا ال رز ززغل NAG3صال النصز ززب ال ز ززاركي مز ززن ه ز ز ا الف ز زراغ وال يز ززت التكامز ززل
المةلوب بين اإلنزي ومادة التفاعل.
الموقع الفعال مئغول
كليا بة NAG6
84
NAG
NAG
NAG
NAG
NAG
NAG
إنزيم الليزوزيم
مكان القطع (عمل اإلنزيم)
الموقع الفعال مئغول
إنزيم الليزوزيم
جزئيا بة NAG3
NAG
NAG
NAG
ص ا صفترلززنا ن مززادة التفاعززل هززي NAG6و ن الوةززدات يرمززز لتززا بززانةر Aصلززم Fفمززا
هي الرابةة التي تتةلل ف م العل ن ناتح التفاعل هو وةدات ثنا ة سNAG2ا ؟
صن الرابةت ز ززان A-Bو B-Cالت ز ززتةلالن نن NAG3وي ز ززر قاب ز ززل للتةل ز ززل ف لز ز ز لم يب ز ززي
اإلةتمزال فزي الزرواب . E-F , D-E , C-Dبمزا ن نزاتح التةلزل هزو وةزدات ثنا زة السزكر
ففن الرابةة المتةللة هي .D-E
Lysozyme
Lysozyme
NAG4
NAG3
85
NAG2
نماذج جزيئية إلنزيم الليزوزيم تم إنجازها عن طريق الكمبيوتر توضح الموقع
الفعال وتحلل NAG6إلى NAG4 + NAG2
وت التعكد من لم بفست دا وةدات سداس ة تربا تركيب كدار البكتريا ستةتزو علزم NAG
و NAMا .يوكد صةتمالين لتركيب ه الوةدات السداس ة
صما NAG-NAM-NAG-NAM-NAG-NAM
و NAM-NAG-NAM-NAG-NAM-NAG
اإلةتمال انول هو الصة ح نن اإلنزي ال عمل علم تةليل الرابةزة بزين NAG-NAM
) (D-Eبينما ةلل ف
الرواب ) NAM-NAG (D-Eفزي االةتمزال انول .باإللزافة صلزم
ل ززم ل ززوةل ن ر ززكل الموقز ز الفع ززال ال س ززمح بوك ززود وة ززدة كبيز زرة سNAMا ف ززي الولز ز C
ساالةتمال الثانيا نم ار نن NAMةتو علم ك ر lactylالكبير.
صن الد ارسززة المفصززلة آلل ززة عمززل صن ززي الل سززوزي سززمةت للعززال Phillipsومسززاعدو بززفقتراب
ال ةوات التال ة في ةري ة عمل اإلنزي :
-1تعة ززي COOHلةم ززض Glu35رة Hل ز ز Oالت ززاب للرابة ززة الكل كوس ززيد ة ب ززين D-E
مما يؤد صلم تكسير الرابةة الكل كوسيد ة C1--Oوتكوين رةنة علم C1للةل ة .D
86
-2تنفصل الوةدة الثنا ة E-Fوتبتعدان عن اإلنزي سالركلا.
-3تزرتب OH-مززن المززال ب ز C1بينمززا تزرتب +Hللمززال ب ز COO-لةمززض Glu35التززي
يتةول صلم . COOH
-4ينفصل الكززل ) NAG4 (A-B-C-Dعزن اإلنززي الز
كاه از ندال دور مرة
رى سالركلا.
87
سزتعيد تركيبزا انصزلي و كزون
وق ززد تز ز بفس ززت دا العناص ززر المر ززعة صثب ززات كت ززة الرابة ززة الكل كوس ززيد ة الت ززي تتةل ززل عن ززدها
الرابةززة بززين )(D-E
. NAM-NAGفبفس زتعمال المززال المةتززو علززم انكسززكين المر ز
H2O18والكرب عن الوةدة السزكرية التزي تةتزو علزم O18بعزد التةلزل تز صثبزات ن الكتزة
المتةللة هي C1---- Oول س .O ----- C4
وه ا يبين مدى هم ة است دا العناصر المرعة في تةديد مل ة عمل اإلنزيمات.
88
Documents similaires
Sur le même sujet..
reversible
glu35
deaminase
phosphorylase
michaelis
thronine
linweaver
irreversible
menten
enzymes
enzyme
inhibition
lysozyme
threonine
acetyl