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Technische toelichting v2 FR .pdf


Nom original: Technische_toelichting_v2_FR.pdf
Titre: G5413-10
Auteur: mddobb0

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ACTIVITEITENCENTRUM
FORENSISCHE GENETICA
EN MOLECULAIRE ARCHEOLOGIE
FORENSISCHE GENEESKUNDE
 
 

La procédure technique 
 
Un  demi‐écouvillon  est  utilisé  pour  l’extraction  de  l’ADN.  Cet  extrait  est  utilisé  pour  établir  un 
haplotype  du  chromosome  Y  par  l’analyse  des  Y‐STRs  (Y  chromosome  Short  Tandem  Repeats) 
suivants: 

 
STR 

Motif répétitif 

Allèles

STR 

DYS448* 
DYS449 

Motif répétitif 
[TAATA]m [TAAAA]1 [TAATA]n 
[TAAAA]1 [TAATA]p 
[AGAGAT]m N42 [AGAGAT]n 
[TTTC]m N50 [TTTC]n 

DYS19* 

[TAGA]3 tagg [TAGA]n 

10‐19 

DYS447* 

10‐18 
9‐17 

17‐24 
24‐36 

24‐34 

DYS454 

[AAAT]n 

10‐12 

17‐28 

DYS455 

[AAAT]n 

8‐12 

6‐14 
6‐17 
9‐17 
10‐14 
13‐17 

DYS456 
DYS458 
DYS460* 
DYS570 
DYS576 

[AGAT]n 
[GAAA]n 
[ATAG]n 
[TTTC]n 
[AAAG]n 

12‐20 
13‐20 
7‐13 
12‐23 
13‐21 

6‐14 

DYS607 

[GAAG]n 

8‐22 

DYS439*  [GATA]n 

9‐15 

GATA H4.1*

DYS442 

15‐20 

 

DYS388  [ATT]n 
DYS389I*  [TCTG]3 [TCTA]n 
[TCTG]m [TCTA]n N28 
DYS389II* 
[TCTG]3 [TCTA]p 
[TCTG]m [TCTA]n [TCTG]p 
DYS390* 
[TCTA]q 
DYS391*  [TCTA]n 
DYS392*  [TAT]n 
DYS393*  [AGAT]n 
DYS426*  [GTT]n 
DYS437*  [TCTA]n [TCTG]1‐3 [TCTA]4 
[TTTTC]1 [TTTTA]0‐1 
DYS438* 
[TTTTC]n 

[TATC]2 [TGTC]3 [TATC]n 

[AGAT]4 CTAT [AGAT]2 [AGGT]3 
[AGAT]n 
 

Allèles
20‐30 

17‐23 
 

 
Multi copy STR 
YCAIIa 
YCAIIb 
DYS385a* 
DYS385b* 
DYS459a 
DYS459b 

Motif répétitif 
[CA]n 
[CA]n 
[GAAA]n 
[GAAA]n 
[TAAA]n 
[TAAA]n 

Allèles 
11‐26 
11‐26 
7‐28 
7‐28 
6‐11 
6‐11 

 
 
 
 
 
 
 

Multi copy STR
DYS464a 
DYS464b 
DYS464c 
DYS464d 
DYS724a 
DYS724b 

Motif répétitif 
[CCTT]n 
[CCTT]n 
[CCTT]n 
[CCTT]n 
[AAAG]m N5 [AAGG]n
[AAAG]m N5 [AAGG]n

Allèles 
10‐20 
10‐20 
10‐20 
10‐20 
26‐46 
26‐46 

* = Y‐STRs pour lesquelles la laboratoire a été accréditée par BELAC (procédures NU AMP 10 et NU AMP 11) 

 
Remarque: DYS19 est aussi connu comme DYS394; DYS724a/b est aussi connu comme CDYa/b; GATA‐H4.1 est 
aussi  connu  comme  GATA‐H4.  La  séquence  indiquée  en  caractères  gras  n’est  pas  inclue  dans  le  nombre  de 
motifs répétitifs. Les STRs multi copies YCAII, DYS385, DYS459, DYS464 et DYS724 sont présents à 2 ou plusieurs 
positions sur le chromosome Y. 

 
La combinaison de DYS19, DYS390, DYS391, DYS392, DYS393, DYS385a/b, DYS389I et DYS389II a été 
nommée  l‘haplotype  minimal’  (www.yhrd.org).  Ce  haplotype  avec  les  Y‐STRs  DYS437,  DYS438  et 
DYS439 est connu comme l'haplotype étendu’. 
 
La combinaison de DYS19, DYS390, DYS391, DYS392, DYS393, DYS385a/b, DYS388, DYS426, DYS439, 
DYS389I  et  DYS389II  est  utilisé  dans  le  projet  ’Génographie’  pour  mettre  en  carte  les  migrations 
pendant les derniers 100.000 années (genographic.nationalgeographic.com). 

 
Campus Sint-Rafaël - Kapucijnenvoer 33 - 3000 Leuven
tel: 016/34.58.60 - fax: 016/34.59.97
www.forensicgenetics.be

Toepassingsdatum: 16/11/2009

ACTIVITEITENCENTRUM
FORENSISCHE GENETICA
EN MOLECULAIRE ARCHEOLOGIE
FORENSISCHE GENEESKUNDE

 
 
La  nomenclature  pour  la  désignation  des  allèles  est  basée sur  les  recommandations  de  l’International 
Society  for  Forensic  Genetics  et  a  été  contrôlé  par  l’analyse  des  échantillons  de  référence  (SRM‐2395)  du 
National  Institute  of  Standards  &  Technology  (VS)  et  par  séquençage  d’allèles  individuels.  Chaque  chiffre 
dans l’haplotype correspond au nombre de motifs répétitifs dans le STR analysé. Un allèle avec l’extension 
".1" contient un motif de répétition incomplet de 1 nucléotide; ".2" correspond à 2 nucléotides; etc. 
 
La  désignation  des  allèles  peut  être  différente  d’autres  laboratoires  faisant  des  analyses  d’ADN  dans  le 
domaine  de  la  généalogie.  Afin  de  comparer  l’haplotype  dans  ce  rapport  aux  haplotypes  déterminés  par 
d’autres laboratoires, le nombre de motifs répétitifs pour certains STR doit être augmenté (“+”) ‐ ou réduit 
(“‐“) – par un nombre de motifs selon les chiffres indiqués dans le tableau suivant: 
 
FamilyTreeDNA (Hwww.familytreedna.comH; 
DNA Heritage (Hwww.dnaheritage.comH; 
ybase) 
ysearch) 
- GATA H4.1 (GATA‐H4) = +1 
- DYS442 = ‐5 
 
- DYS607 = ‐4 
- GATA H4.1 (GATA‐H4) = ‐10 
Oxford Ancestors 
Genographic Project
(Hwww.oxfordanestors.comH; yline) 
(Hgenographic.nationalgeographic.comH) 
- DYS389I = ‐3 
- DYS389II = ‐ DYS389I 
- DYS389II = ‐3 en ‐ DYS389I 
Pas d’adaptions: 
Sorensen Molecular Genealogy Foundation (Hwww.smgf.orgH)  
 

 
L’haplogroupe  est  déterminé  sur  base  de  l’haplotype  Y‐STR.  Le  sous‐haplogroupe  sera  défini  par 
l’analyse des SNP (Single Nucleotide Polymorphisms) individuels qui sont spécifiques pour ces sous‐
haplogroupe.  La  nomenclature  du  consortium  international  du  chromosome  Y 
(ycc.biosci.arizona.edu/) est suivie pour la désignation du sous‐haplogroupe.  

  
Le laboratoire travail sous la norme ISO17025. Les procédures techniques faisant partie des procédures 
accrédités par BELAC (ISO17025 BELAC 218‐TEST), sont: 
‐ 3230  "Ontvangst en afname van stalen voor onderzoek" 
‐ KWANT 2 " DNA‐bepaling met Quantifiler Human DNA Quantification Kit" 
‐ NU AMP 10 "Amplificatie met Powerplex Y System" 
‐ NU AMP 11 "Amplificatie van Multiplex Y5 System" 
‐ NU ABI 2 "Scheiding van nucleair DNA op de ABI PRISM 3130XL Genetic Analyzer" 
‐ NU ANA 3 "Genotypering van nucleair DNA op de ABI PRISM 3130XL Genetic Analyzer: GeneMapper" 
‐ INTERPRETATIE 1 "Interpretatie van de nucleaire resultaten"

 
  
 

Campus Sint-Rafaël - Kapucijnenvoer 33 - 3000 Leuven
tel: 016/34.58.60 - fax: 016/34.59.97
www.forensicgenetics.be

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