Technische toelichting v2 FR .pdf
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ACTIVITEITENCENTRUM
FORENSISCHE GENETICA
EN MOLECULAIRE ARCHEOLOGIE
FORENSISCHE GENEESKUNDE
La procédure technique
Un demi‐écouvillon est utilisé pour l’extraction de l’ADN. Cet extrait est utilisé pour établir un
haplotype du chromosome Y par l’analyse des Y‐STRs (Y chromosome Short Tandem Repeats)
suivants:
STR
Motif répétitif
Allèles
STR
DYS448*
DYS449
Motif répétitif
[TAATA]m [TAAAA]1 [TAATA]n
[TAAAA]1 [TAATA]p
[AGAGAT]m N42 [AGAGAT]n
[TTTC]m N50 [TTTC]n
DYS19*
[TAGA]3 tagg [TAGA]n
10‐19
DYS447*
10‐18
9‐17
17‐24
24‐36
24‐34
DYS454
[AAAT]n
10‐12
17‐28
DYS455
[AAAT]n
8‐12
6‐14
6‐17
9‐17
10‐14
13‐17
DYS456
DYS458
DYS460*
DYS570
DYS576
[AGAT]n
[GAAA]n
[ATAG]n
[TTTC]n
[AAAG]n
12‐20
13‐20
7‐13
12‐23
13‐21
6‐14
DYS607
[GAAG]n
8‐22
DYS439* [GATA]n
9‐15
GATA H4.1*
DYS442
15‐20
DYS388 [ATT]n
DYS389I* [TCTG]3 [TCTA]n
[TCTG]m [TCTA]n N28
DYS389II*
[TCTG]3 [TCTA]p
[TCTG]m [TCTA]n [TCTG]p
DYS390*
[TCTA]q
DYS391* [TCTA]n
DYS392* [TAT]n
DYS393* [AGAT]n
DYS426* [GTT]n
DYS437* [TCTA]n [TCTG]1‐3 [TCTA]4
[TTTTC]1 [TTTTA]0‐1
DYS438*
[TTTTC]n
[TATC]2 [TGTC]3 [TATC]n
[AGAT]4 CTAT [AGAT]2 [AGGT]3
[AGAT]n
Allèles
20‐30
17‐23
Multi copy STR
YCAIIa
YCAIIb
DYS385a*
DYS385b*
DYS459a
DYS459b
Motif répétitif
[CA]n
[CA]n
[GAAA]n
[GAAA]n
[TAAA]n
[TAAA]n
Allèles
11‐26
11‐26
7‐28
7‐28
6‐11
6‐11
Multi copy STR
DYS464a
DYS464b
DYS464c
DYS464d
DYS724a
DYS724b
Motif répétitif
[CCTT]n
[CCTT]n
[CCTT]n
[CCTT]n
[AAAG]m N5 [AAGG]n
[AAAG]m N5 [AAGG]n
Allèles
10‐20
10‐20
10‐20
10‐20
26‐46
26‐46
* = Y‐STRs pour lesquelles la laboratoire a été accréditée par BELAC (procédures NU AMP 10 et NU AMP 11)
Remarque: DYS19 est aussi connu comme DYS394; DYS724a/b est aussi connu comme CDYa/b; GATA‐H4.1 est
aussi connu comme GATA‐H4. La séquence indiquée en caractères gras n’est pas inclue dans le nombre de
motifs répétitifs. Les STRs multi copies YCAII, DYS385, DYS459, DYS464 et DYS724 sont présents à 2 ou plusieurs
positions sur le chromosome Y.
La combinaison de DYS19, DYS390, DYS391, DYS392, DYS393, DYS385a/b, DYS389I et DYS389II a été
nommée l‘haplotype minimal’ (www.yhrd.org). Ce haplotype avec les Y‐STRs DYS437, DYS438 et
DYS439 est connu comme l'haplotype étendu’.
La combinaison de DYS19, DYS390, DYS391, DYS392, DYS393, DYS385a/b, DYS388, DYS426, DYS439,
DYS389I et DYS389II est utilisé dans le projet ’Génographie’ pour mettre en carte les migrations
pendant les derniers 100.000 années (genographic.nationalgeographic.com).
Campus Sint-Rafaël - Kapucijnenvoer 33 - 3000 Leuven
tel: 016/34.58.60 - fax: 016/34.59.97
www.forensicgenetics.be
Toepassingsdatum: 16/11/2009
ACTIVITEITENCENTRUM
FORENSISCHE GENETICA
EN MOLECULAIRE ARCHEOLOGIE
FORENSISCHE GENEESKUNDE
La nomenclature pour la désignation des allèles est basée sur les recommandations de l’International
Society for Forensic Genetics et a été contrôlé par l’analyse des échantillons de référence (SRM‐2395) du
National Institute of Standards & Technology (VS) et par séquençage d’allèles individuels. Chaque chiffre
dans l’haplotype correspond au nombre de motifs répétitifs dans le STR analysé. Un allèle avec l’extension
".1" contient un motif de répétition incomplet de 1 nucléotide; ".2" correspond à 2 nucléotides; etc.
La désignation des allèles peut être différente d’autres laboratoires faisant des analyses d’ADN dans le
domaine de la généalogie. Afin de comparer l’haplotype dans ce rapport aux haplotypes déterminés par
d’autres laboratoires, le nombre de motifs répétitifs pour certains STR doit être augmenté (“+”) ‐ ou réduit
(“‐“) – par un nombre de motifs selon les chiffres indiqués dans le tableau suivant:
FamilyTreeDNA (Hwww.familytreedna.comH;
DNA Heritage (Hwww.dnaheritage.comH;
ybase)
ysearch)
- GATA H4.1 (GATA‐H4) = +1
- DYS442 = ‐5
- DYS607 = ‐4
- GATA H4.1 (GATA‐H4) = ‐10
Oxford Ancestors
Genographic Project
(Hwww.oxfordanestors.comH; yline)
(Hgenographic.nationalgeographic.comH)
- DYS389I = ‐3
- DYS389II = ‐ DYS389I
- DYS389II = ‐3 en ‐ DYS389I
Pas d’adaptions:
Sorensen Molecular Genealogy Foundation (Hwww.smgf.orgH)
L’haplogroupe est déterminé sur base de l’haplotype Y‐STR. Le sous‐haplogroupe sera défini par
l’analyse des SNP (Single Nucleotide Polymorphisms) individuels qui sont spécifiques pour ces sous‐
haplogroupe. La nomenclature du consortium international du chromosome Y
(ycc.biosci.arizona.edu/) est suivie pour la désignation du sous‐haplogroupe.
Le laboratoire travail sous la norme ISO17025. Les procédures techniques faisant partie des procédures
accrédités par BELAC (ISO17025 BELAC 218‐TEST), sont:
‐ 3230 "Ontvangst en afname van stalen voor onderzoek"
‐ KWANT 2 " DNA‐bepaling met Quantifiler Human DNA Quantification Kit"
‐ NU AMP 10 "Amplificatie met Powerplex Y System"
‐ NU AMP 11 "Amplificatie van Multiplex Y5 System"
‐ NU ABI 2 "Scheiding van nucleair DNA op de ABI PRISM 3130XL Genetic Analyzer"
‐ NU ANA 3 "Genotypering van nucleair DNA op de ABI PRISM 3130XL Genetic Analyzer: GeneMapper"
‐ INTERPRETATIE 1 "Interpretatie van de nucleaire resultaten"
Campus Sint-Rafaël - Kapucijnenvoer 33 - 3000 Leuven
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